Protein–RNA interactions for Protein: Q69ZA1

Cdk13, Cyclin-dependent kinase 13, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,511 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdk13Q69ZA1 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
Cdk13Q69ZA1 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Cdk13Q69ZA1 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC25.95■■□□□ 1.74
Cdk13Q69ZA1 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
Cdk13Q69ZA1 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Cdk13Q69ZA1 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
Cdk13Q69ZA1 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
Cdk13Q69ZA1 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC25.94■■□□□ 1.74
Cdk13Q69ZA1 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Cdk13Q69ZA1 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Cdk13Q69ZA1 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
Cdk13Q69ZA1 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Cdk13Q69ZA1 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Cdk13Q69ZA1 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Cdk13Q69ZA1 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Cdk13Q69ZA1 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Cdk13Q69ZA1 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Cdk13Q69ZA1 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Cdk13Q69ZA1 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Cdk13Q69ZA1 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
Cdk13Q69ZA1 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Cdk13Q69ZA1 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Cdk13Q69ZA1 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Cdk13Q69ZA1 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Cdk13Q69ZA1 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Cdk13Q69ZA1 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
Cdk13Q69ZA1 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Cdk13Q69ZA1 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Cdk13Q69ZA1 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Cdk13Q69ZA1 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Cdk13Q69ZA1 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Cdk13Q69ZA1 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Cdk13Q69ZA1 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Cdk13Q69ZA1 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Cdk13Q69ZA1 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Cdk13Q69ZA1 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
Cdk13Q69ZA1 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Cdk13Q69ZA1 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Cdk13Q69ZA1 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Cdk13Q69ZA1 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Cdk13Q69ZA1 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
Cdk13Q69ZA1 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Cdk13Q69ZA1 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Cdk13Q69ZA1 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
Cdk13Q69ZA1 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Cdk13Q69ZA1 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Cdk13Q69ZA1 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
Cdk13Q69ZA1 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
Cdk13Q69ZA1 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
Cdk13Q69ZA1 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Cdk13Q69ZA1 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Cdk13Q69ZA1 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Cdk13Q69ZA1 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
Cdk13Q69ZA1 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Cdk13Q69ZA1 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Cdk13Q69ZA1 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Cdk13Q69ZA1 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Cdk13Q69ZA1 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Cdk13Q69ZA1 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Cdk13Q69ZA1 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
Cdk13Q69ZA1 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC25.89■■□□□ 1.73
Cdk13Q69ZA1 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
Cdk13Q69ZA1 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC25.89■■□□□ 1.73
Cdk13Q69ZA1 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Cdk13Q69ZA1 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Cdk13Q69ZA1 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Cdk13Q69ZA1 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
Cdk13Q69ZA1 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Cdk13Q69ZA1 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Cdk13Q69ZA1 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Cdk13Q69ZA1 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Cdk13Q69ZA1 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Cdk13Q69ZA1 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Cdk13Q69ZA1 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Cdk13Q69ZA1 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Cdk13Q69ZA1 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Cdk13Q69ZA1 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Cdk13Q69ZA1 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
Cdk13Q69ZA1 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Cdk13Q69ZA1 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Cdk13Q69ZA1 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Cdk13Q69ZA1 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Cdk13Q69ZA1 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
Cdk13Q69ZA1 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
Cdk13Q69ZA1 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Cdk13Q69ZA1 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Cdk13Q69ZA1 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Cdk13Q69ZA1 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Cdk13Q69ZA1 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Cdk13Q69ZA1 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Cdk13Q69ZA1 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
Cdk13Q69ZA1 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
Cdk13Q69ZA1 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
Cdk13Q69ZA1 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC25.86■■□□□ 1.73
Cdk13Q69ZA1 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
Cdk13Q69ZA1 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Cdk13Q69ZA1 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC25.86■■□□□ 1.73
Cdk13Q69ZA1 Gsg1-201ENSMUST00000087729 1307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Cdk13Q69ZA1 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Cdk13Q69ZA1 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.9 ms