Protein–RNA interactions for Protein: Q68FG2

Sptbn2, Spectrin beta chain, mousemouse

Predictions only

Length 2,388 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sptbn2Q68FG2 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sptbn2Q68FG2 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sptbn2Q68FG2 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sptbn2Q68FG2 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Sptbn2Q68FG2 Prr3-202ENSMUST00000165613 767 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sptbn2Q68FG2 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sptbn2Q68FG2 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sptbn2Q68FG2 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sptbn2Q68FG2 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sptbn2Q68FG2 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sptbn2Q68FG2 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sptbn2Q68FG2 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sptbn2Q68FG2 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sptbn2Q68FG2 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sptbn2Q68FG2 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sptbn2Q68FG2 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sptbn2Q68FG2 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sptbn2Q68FG2 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sptbn2Q68FG2 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sptbn2Q68FG2 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sptbn2Q68FG2 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Sptbn2Q68FG2 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sptbn2Q68FG2 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Sptbn2Q68FG2 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sptbn2Q68FG2 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sptbn2Q68FG2 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sptbn2Q68FG2 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sptbn2Q68FG2 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sptbn2Q68FG2 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sptbn2Q68FG2 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sptbn2Q68FG2 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sptbn2Q68FG2 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sptbn2Q68FG2 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sptbn2Q68FG2 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Sptbn2Q68FG2 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sptbn2Q68FG2 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sptbn2Q68FG2 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sptbn2Q68FG2 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sptbn2Q68FG2 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sptbn2Q68FG2 Ppil3-202ENSMUST00000114345 1175 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sptbn2Q68FG2 Ndufaf8-202ENSMUST00000185558 427 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sptbn2Q68FG2 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Sptbn2Q68FG2 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sptbn2Q68FG2 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sptbn2Q68FG2 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sptbn2Q68FG2 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sptbn2Q68FG2 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Sptbn2Q68FG2 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Sptbn2Q68FG2 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Sptbn2Q68FG2 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Sptbn2Q68FG2 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Sptbn2Q68FG2 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Sptbn2Q68FG2 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Sptbn2Q68FG2 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Sptbn2Q68FG2 1700019N19Rik-201ENSMUST00000028299 970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Sptbn2Q68FG2 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Sptbn2Q68FG2 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Sptbn2Q68FG2 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Sptbn2Q68FG2 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Sptbn2Q68FG2 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Sptbn2Q68FG2 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Sptbn2Q68FG2 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Sptbn2Q68FG2 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Sptbn2Q68FG2 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Sptbn2Q68FG2 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Sptbn2Q68FG2 Alas2-201ENSMUST00000066337 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Sptbn2Q68FG2 Gm6443-201ENSMUST00000203599 874 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Sptbn2Q68FG2 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Sptbn2Q68FG2 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Sptbn2Q68FG2 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Sptbn2Q68FG2 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Sptbn2Q68FG2 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Sptbn2Q68FG2 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Sptbn2Q68FG2 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Sptbn2Q68FG2 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Sptbn2Q68FG2 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Sptbn2Q68FG2 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Sptbn2Q68FG2 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Sptbn2Q68FG2 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Sptbn2Q68FG2 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Sptbn2Q68FG2 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Sptbn2Q68FG2 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Sptbn2Q68FG2 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Sptbn2Q68FG2 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Sptbn2Q68FG2 Prss22-201ENSMUST00000041649 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Sptbn2Q68FG2 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Sptbn2Q68FG2 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Sptbn2Q68FG2 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Sptbn2Q68FG2 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Sptbn2Q68FG2 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Sptbn2Q68FG2 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Sptbn2Q68FG2 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Sptbn2Q68FG2 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Sptbn2Q68FG2 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Sptbn2Q68FG2 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Sptbn2Q68FG2 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Sptbn2Q68FG2 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Sptbn2Q68FG2 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Sptbn2Q68FG2 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Sptbn2Q68FG2 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.5 ms