Protein–RNA interactions for Protein: Q68FF6

Git1, ARF GTPase-activating protein GIT1, mousemouse

Predictions only

Length 770 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Git1Q68FF6 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Git1Q68FF6 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Git1Q68FF6 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Git1Q68FF6 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Git1Q68FF6 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Git1Q68FF6 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Git1Q68FF6 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Git1Q68FF6 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Git1Q68FF6 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Git1Q68FF6 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Git1Q68FF6 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Git1Q68FF6 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Git1Q68FF6 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Git1Q68FF6 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Git1Q68FF6 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Git1Q68FF6 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Git1Q68FF6 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Git1Q68FF6 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Git1Q68FF6 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Git1Q68FF6 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Git1Q68FF6 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Git1Q68FF6 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Git1Q68FF6 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Git1Q68FF6 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Git1Q68FF6 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Git1Q68FF6 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Git1Q68FF6 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Git1Q68FF6 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Git1Q68FF6 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Git1Q68FF6 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Git1Q68FF6 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Git1Q68FF6 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Git1Q68FF6 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Git1Q68FF6 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Git1Q68FF6 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Git1Q68FF6 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Git1Q68FF6 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Git1Q68FF6 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Git1Q68FF6 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Git1Q68FF6 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Git1Q68FF6 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Git1Q68FF6 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Git1Q68FF6 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Git1Q68FF6 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Git1Q68FF6 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Git1Q68FF6 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Git1Q68FF6 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Git1Q68FF6 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Git1Q68FF6 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Git1Q68FF6 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Git1Q68FF6 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Git1Q68FF6 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Git1Q68FF6 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Git1Q68FF6 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Git1Q68FF6 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Git1Q68FF6 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Git1Q68FF6 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Git1Q68FF6 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Git1Q68FF6 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Git1Q68FF6 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Git1Q68FF6 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Git1Q68FF6 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Git1Q68FF6 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Git1Q68FF6 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Git1Q68FF6 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Git1Q68FF6 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Git1Q68FF6 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Git1Q68FF6 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Git1Q68FF6 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Git1Q68FF6 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Git1Q68FF6 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
Git1Q68FF6 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Git1Q68FF6 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Git1Q68FF6 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Git1Q68FF6 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Git1Q68FF6 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
Git1Q68FF6 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Git1Q68FF6 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Git1Q68FF6 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Git1Q68FF6 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Git1Q68FF6 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Git1Q68FF6 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Git1Q68FF6 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Git1Q68FF6 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Git1Q68FF6 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Git1Q68FF6 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Git1Q68FF6 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Git1Q68FF6 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Git1Q68FF6 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Git1Q68FF6 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Git1Q68FF6 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Git1Q68FF6 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Git1Q68FF6 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Git1Q68FF6 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Git1Q68FF6 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Git1Q68FF6 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Git1Q68FF6 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Git1Q68FF6 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Git1Q68FF6 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Git1Q68FF6 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.4 ms