Protein–RNA interactions for Protein: Q68EF0

Rab3ip, Rab-3A-interacting protein, mousemouse

Predictions only

Length 428 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab3ipQ68EF0 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Rab3ipQ68EF0 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Rab3ipQ68EF0 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Rab3ipQ68EF0 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Rab3ipQ68EF0 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Rab3ipQ68EF0 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Rab3ipQ68EF0 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Rab3ipQ68EF0 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Rab3ipQ68EF0 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Rab3ipQ68EF0 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Rab3ipQ68EF0 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Rab3ipQ68EF0 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Rab3ipQ68EF0 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rab3ipQ68EF0 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rab3ipQ68EF0 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rab3ipQ68EF0 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rab3ipQ68EF0 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rab3ipQ68EF0 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rab3ipQ68EF0 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rab3ipQ68EF0 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rab3ipQ68EF0 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rab3ipQ68EF0 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rab3ipQ68EF0 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rab3ipQ68EF0 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rab3ipQ68EF0 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Rab3ipQ68EF0 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Rab3ipQ68EF0 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rab3ipQ68EF0 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Rab3ipQ68EF0 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rab3ipQ68EF0 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rab3ipQ68EF0 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rab3ipQ68EF0 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rab3ipQ68EF0 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rab3ipQ68EF0 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rab3ipQ68EF0 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rab3ipQ68EF0 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rab3ipQ68EF0 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rab3ipQ68EF0 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rab3ipQ68EF0 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rab3ipQ68EF0 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rab3ipQ68EF0 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rab3ipQ68EF0 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rab3ipQ68EF0 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rab3ipQ68EF0 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rab3ipQ68EF0 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Rab3ipQ68EF0 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rab3ipQ68EF0 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rab3ipQ68EF0 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rab3ipQ68EF0 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rab3ipQ68EF0 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rab3ipQ68EF0 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rab3ipQ68EF0 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rab3ipQ68EF0 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rab3ipQ68EF0 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rab3ipQ68EF0 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rab3ipQ68EF0 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Rab3ipQ68EF0 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rab3ipQ68EF0 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rab3ipQ68EF0 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rab3ipQ68EF0 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rab3ipQ68EF0 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rab3ipQ68EF0 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rab3ipQ68EF0 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rab3ipQ68EF0 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rab3ipQ68EF0 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rab3ipQ68EF0 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rab3ipQ68EF0 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rab3ipQ68EF0 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rab3ipQ68EF0 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rab3ipQ68EF0 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rab3ipQ68EF0 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rab3ipQ68EF0 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rab3ipQ68EF0 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rab3ipQ68EF0 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rab3ipQ68EF0 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rab3ipQ68EF0 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rab3ipQ68EF0 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rab3ipQ68EF0 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rab3ipQ68EF0 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rab3ipQ68EF0 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rab3ipQ68EF0 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rab3ipQ68EF0 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rab3ipQ68EF0 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rab3ipQ68EF0 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rab3ipQ68EF0 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rab3ipQ68EF0 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rab3ipQ68EF0 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rab3ipQ68EF0 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rab3ipQ68EF0 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rab3ipQ68EF0 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rab3ipQ68EF0 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rab3ipQ68EF0 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rab3ipQ68EF0 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rab3ipQ68EF0 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rab3ipQ68EF0 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rab3ipQ68EF0 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rab3ipQ68EF0 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rab3ipQ68EF0 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rab3ipQ68EF0 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rab3ipQ68EF0 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.6 ms