Protein–RNA interactions for Protein: Q684R7

Frem1, FRAS1-related extracellular matrix protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 2,191 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Frem1Q684R7 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
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Frem1Q684R7 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Frem1Q684R7 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Frem1Q684R7 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Frem1Q684R7 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Frem1Q684R7 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Frem1Q684R7 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
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Frem1Q684R7 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Frem1Q684R7 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Frem1Q684R7 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Frem1Q684R7 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Frem1Q684R7 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Frem1Q684R7 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Frem1Q684R7 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Frem1Q684R7 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
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Frem1Q684R7 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Frem1Q684R7 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Frem1Q684R7 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Frem1Q684R7 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
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Frem1Q684R7 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Frem1Q684R7 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Frem1Q684R7 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Frem1Q684R7 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Frem1Q684R7 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Frem1Q684R7 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Frem1Q684R7 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Frem1Q684R7 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Frem1Q684R7 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Frem1Q684R7 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Frem1Q684R7 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Frem1Q684R7 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
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Frem1Q684R7 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Frem1Q684R7 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
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Frem1Q684R7 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Frem1Q684R7 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
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Frem1Q684R7 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
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Frem1Q684R7 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Frem1Q684R7 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
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Frem1Q684R7 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Frem1Q684R7 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Frem1Q684R7 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Frem1Q684R7 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Frem1Q684R7 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Frem1Q684R7 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
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Frem1Q684R7 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Frem1Q684R7 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Frem1Q684R7 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Frem1Q684R7 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Frem1Q684R7 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Frem1Q684R7 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Frem1Q684R7 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Frem1Q684R7 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Frem1Q684R7 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Frem1Q684R7 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Frem1Q684R7 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Frem1Q684R7 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Frem1Q684R7 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Frem1Q684R7 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Frem1Q684R7 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Frem1Q684R7 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Frem1Q684R7 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Frem1Q684R7 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Frem1Q684R7 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.7 ms