Protein–RNA interactions for Protein: Q64727

Vcl, Vinculin, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,066 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VclQ64727 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
VclQ64727 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
VclQ64727 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
VclQ64727 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
VclQ64727 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
VclQ64727 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
VclQ64727 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
VclQ64727 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
VclQ64727 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
VclQ64727 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
VclQ64727 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
VclQ64727 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
VclQ64727 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
VclQ64727 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
VclQ64727 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
VclQ64727 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
VclQ64727 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
VclQ64727 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
VclQ64727 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
VclQ64727 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
VclQ64727 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
VclQ64727 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
VclQ64727 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
VclQ64727 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
VclQ64727 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
VclQ64727 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
VclQ64727 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
VclQ64727 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
VclQ64727 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
VclQ64727 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
VclQ64727 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
VclQ64727 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
VclQ64727 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
VclQ64727 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
VclQ64727 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
VclQ64727 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
VclQ64727 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
VclQ64727 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
VclQ64727 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC18■□□□□ 0.47
VclQ64727 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
VclQ64727 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
VclQ64727 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
VclQ64727 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
VclQ64727 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
VclQ64727 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
VclQ64727 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
VclQ64727 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
VclQ64727 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
VclQ64727 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
VclQ64727 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
VclQ64727 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
VclQ64727 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
VclQ64727 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
VclQ64727 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
VclQ64727 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
VclQ64727 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
VclQ64727 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
VclQ64727 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
VclQ64727 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
VclQ64727 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
VclQ64727 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
VclQ64727 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
VclQ64727 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
VclQ64727 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
VclQ64727 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
VclQ64727 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
VclQ64727 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
VclQ64727 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
VclQ64727 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
VclQ64727 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
VclQ64727 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
VclQ64727 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
VclQ64727 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
VclQ64727 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
VclQ64727 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
VclQ64727 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
VclQ64727 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
VclQ64727 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
VclQ64727 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
VclQ64727 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
VclQ64727 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
VclQ64727 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
VclQ64727 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
VclQ64727 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
VclQ64727 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
VclQ64727 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
VclQ64727 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
VclQ64727 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
VclQ64727 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
VclQ64727 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
VclQ64727 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
VclQ64727 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
VclQ64727 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
VclQ64727 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
VclQ64727 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
VclQ64727 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
VclQ64727 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
VclQ64727 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.47
VclQ64727 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
VclQ64727 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.5 ms