Protein–RNA interactions for Protein: Q640N1

Aebp1, Adipocyte enhancer-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,128 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Aebp1Q640N1 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Aebp1Q640N1 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Aebp1Q640N1 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Aebp1Q640N1 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
Aebp1Q640N1 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Aebp1Q640N1 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
Aebp1Q640N1 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC28.14■■■□□ 2.09
Aebp1Q640N1 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
Aebp1Q640N1 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Aebp1Q640N1 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
Aebp1Q640N1 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
Aebp1Q640N1 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
Aebp1Q640N1 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC28.13■■■□□ 2.09
Aebp1Q640N1 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
Aebp1Q640N1 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Aebp1Q640N1 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Aebp1Q640N1 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Aebp1Q640N1 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Aebp1Q640N1 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Aebp1Q640N1 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Aebp1Q640N1 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
Aebp1Q640N1 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Aebp1Q640N1 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Aebp1Q640N1 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Aebp1Q640N1 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Aebp1Q640N1 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Aebp1Q640N1 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Aebp1Q640N1 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
Aebp1Q640N1 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
Aebp1Q640N1 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
Aebp1Q640N1 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Aebp1Q640N1 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Aebp1Q640N1 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Aebp1Q640N1 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Aebp1Q640N1 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Aebp1Q640N1 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Aebp1Q640N1 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Aebp1Q640N1 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Aebp1Q640N1 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.09■■■□□ 2.09
Aebp1Q640N1 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Aebp1Q640N1 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Aebp1Q640N1 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
Aebp1Q640N1 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC28.09■■■□□ 2.09
Aebp1Q640N1 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Aebp1Q640N1 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Aebp1Q640N1 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Aebp1Q640N1 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Aebp1Q640N1 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Aebp1Q640N1 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
Aebp1Q640N1 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Aebp1Q640N1 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
Aebp1Q640N1 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC28.08■■■□□ 2.09
Aebp1Q640N1 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
Aebp1Q640N1 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Aebp1Q640N1 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
Aebp1Q640N1 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Aebp1Q640N1 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Aebp1Q640N1 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Aebp1Q640N1 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
Aebp1Q640N1 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Aebp1Q640N1 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Aebp1Q640N1 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Aebp1Q640N1 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
Aebp1Q640N1 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
Aebp1Q640N1 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Aebp1Q640N1 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
Aebp1Q640N1 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
Aebp1Q640N1 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Aebp1Q640N1 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Aebp1Q640N1 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Aebp1Q640N1 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Aebp1Q640N1 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
Aebp1Q640N1 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
Aebp1Q640N1 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Aebp1Q640N1 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC28.05■■■□□ 2.08
Aebp1Q640N1 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Aebp1Q640N1 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC28.05■■■□□ 2.08
Aebp1Q640N1 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Aebp1Q640N1 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Aebp1Q640N1 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Aebp1Q640N1 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
Aebp1Q640N1 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Aebp1Q640N1 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
Aebp1Q640N1 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
Aebp1Q640N1 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Aebp1Q640N1 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
Aebp1Q640N1 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Aebp1Q640N1 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
Aebp1Q640N1 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Aebp1Q640N1 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
Aebp1Q640N1 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Aebp1Q640N1 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
Aebp1Q640N1 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Aebp1Q640N1 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Aebp1Q640N1 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC28.03■■■□□ 2.08
Aebp1Q640N1 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Aebp1Q640N1 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Aebp1Q640N1 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Aebp1Q640N1 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
Aebp1Q640N1 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.6 ms