Protein–RNA interactions for Protein: Q63ZW6

Col4a5, Col4a5 protein, mousemouse

Predictions only

Length 1,691 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col4a5Q63ZW6 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Col4a5Q63ZW6 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Col4a5Q63ZW6 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Col4a5Q63ZW6 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Col4a5Q63ZW6 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Col4a5Q63ZW6 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Col4a5Q63ZW6 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Col4a5Q63ZW6 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Col4a5Q63ZW6 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Col4a5Q63ZW6 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Col4a5Q63ZW6 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Col4a5Q63ZW6 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Col4a5Q63ZW6 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Col4a5Q63ZW6 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Col4a5Q63ZW6 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Col4a5Q63ZW6 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Col4a5Q63ZW6 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Col4a5Q63ZW6 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Col4a5Q63ZW6 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Col4a5Q63ZW6 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Col4a5Q63ZW6 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Col4a5Q63ZW6 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Col4a5Q63ZW6 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Col4a5Q63ZW6 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Col4a5Q63ZW6 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Col4a5Q63ZW6 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Col4a5Q63ZW6 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Col4a5Q63ZW6 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Col4a5Q63ZW6 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Col4a5Q63ZW6 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Col4a5Q63ZW6 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Col4a5Q63ZW6 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Col4a5Q63ZW6 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Col4a5Q63ZW6 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Col4a5Q63ZW6 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Col4a5Q63ZW6 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Col4a5Q63ZW6 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Col4a5Q63ZW6 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Col4a5Q63ZW6 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Col4a5Q63ZW6 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Col4a5Q63ZW6 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Col4a5Q63ZW6 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Col4a5Q63ZW6 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Col4a5Q63ZW6 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Col4a5Q63ZW6 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Col4a5Q63ZW6 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Col4a5Q63ZW6 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Col4a5Q63ZW6 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Col4a5Q63ZW6 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Col4a5Q63ZW6 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Col4a5Q63ZW6 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Col4a5Q63ZW6 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Col4a5Q63ZW6 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Col4a5Q63ZW6 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Col4a5Q63ZW6 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Col4a5Q63ZW6 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Col4a5Q63ZW6 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Col4a5Q63ZW6 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Col4a5Q63ZW6 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Col4a5Q63ZW6 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Col4a5Q63ZW6 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Col4a5Q63ZW6 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Col4a5Q63ZW6 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Col4a5Q63ZW6 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Col4a5Q63ZW6 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Col4a5Q63ZW6 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Col4a5Q63ZW6 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Col4a5Q63ZW6 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Col4a5Q63ZW6 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Col4a5Q63ZW6 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Col4a5Q63ZW6 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Col4a5Q63ZW6 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Col4a5Q63ZW6 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Col4a5Q63ZW6 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Col4a5Q63ZW6 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Col4a5Q63ZW6 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Col4a5Q63ZW6 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Col4a5Q63ZW6 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Col4a5Q63ZW6 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Col4a5Q63ZW6 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Col4a5Q63ZW6 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Col4a5Q63ZW6 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Col4a5Q63ZW6 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Col4a5Q63ZW6 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Col4a5Q63ZW6 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Col4a5Q63ZW6 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Col4a5Q63ZW6 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Col4a5Q63ZW6 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Col4a5Q63ZW6 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Col4a5Q63ZW6 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Col4a5Q63ZW6 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Col4a5Q63ZW6 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Col4a5Q63ZW6 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Col4a5Q63ZW6 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Col4a5Q63ZW6 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Col4a5Q63ZW6 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Col4a5Q63ZW6 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Col4a5Q63ZW6 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Col4a5Q63ZW6 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Col4a5Q63ZW6 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.2 ms