Protein–RNA interactions for Protein: Q62443

Nptx1, Neuronal pentraxin-1, mousemouse

Predictions only

Length 432 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nptx1Q62443 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Nptx1Q62443 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Nptx1Q62443 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Nptx1Q62443 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Nptx1Q62443 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Nptx1Q62443 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Nptx1Q62443 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Nptx1Q62443 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Nptx1Q62443 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Nptx1Q62443 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Nptx1Q62443 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Nptx1Q62443 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Nptx1Q62443 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Nptx1Q62443 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Nptx1Q62443 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Nptx1Q62443 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Nptx1Q62443 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Nptx1Q62443 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Nptx1Q62443 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Nptx1Q62443 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Nptx1Q62443 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Nptx1Q62443 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Nptx1Q62443 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Nptx1Q62443 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Nptx1Q62443 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Nptx1Q62443 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Nptx1Q62443 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Nptx1Q62443 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Nptx1Q62443 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Nptx1Q62443 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Nptx1Q62443 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Nptx1Q62443 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Nptx1Q62443 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Nptx1Q62443 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Nptx1Q62443 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Nptx1Q62443 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Nptx1Q62443 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Nptx1Q62443 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Nptx1Q62443 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Nptx1Q62443 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Nptx1Q62443 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Nptx1Q62443 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Nptx1Q62443 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Nptx1Q62443 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Nptx1Q62443 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Nptx1Q62443 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Nptx1Q62443 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Nptx1Q62443 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Nptx1Q62443 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Nptx1Q62443 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Nptx1Q62443 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Nptx1Q62443 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Nptx1Q62443 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Nptx1Q62443 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Nptx1Q62443 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Nptx1Q62443 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Nptx1Q62443 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Nptx1Q62443 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Nptx1Q62443 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Nptx1Q62443 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Nptx1Q62443 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Nptx1Q62443 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Nptx1Q62443 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Nptx1Q62443 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Nptx1Q62443 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Nptx1Q62443 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Nptx1Q62443 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Nptx1Q62443 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Nptx1Q62443 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Nptx1Q62443 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Nptx1Q62443 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Nptx1Q62443 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Nptx1Q62443 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Nptx1Q62443 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Nptx1Q62443 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Nptx1Q62443 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Nptx1Q62443 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Nptx1Q62443 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Nptx1Q62443 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Nptx1Q62443 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Nptx1Q62443 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Nptx1Q62443 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Nptx1Q62443 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nptx1Q62443 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Nptx1Q62443 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nptx1Q62443 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nptx1Q62443 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nptx1Q62443 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nptx1Q62443 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nptx1Q62443 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nptx1Q62443 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nptx1Q62443 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nptx1Q62443 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Nptx1Q62443 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nptx1Q62443 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nptx1Q62443 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nptx1Q62443 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nptx1Q62443 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nptx1Q62443 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Nptx1Q62443 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.9 ms