Protein–RNA interactions for Protein: Q62424

Hoxa13, Homeobox protein Hox-A13, mousemouse

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Length 386 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxa13Q62424 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Hoxa13Q62424 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Hoxa13Q62424 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Hoxa13Q62424 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC20.69■□□□□ 0.9
Hoxa13Q62424 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC20.69■□□□□ 0.9
Hoxa13Q62424 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Hoxa13Q62424 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Hoxa13Q62424 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC20.69■□□□□ 0.9
Hoxa13Q62424 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Hoxa13Q62424 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
Hoxa13Q62424 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Hoxa13Q62424 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Hoxa13Q62424 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Hoxa13Q62424 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC20.68■□□□□ 0.9
Hoxa13Q62424 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC20.68■□□□□ 0.9
Hoxa13Q62424 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC20.68■□□□□ 0.9
Hoxa13Q62424 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Hoxa13Q62424 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Hoxa13Q62424 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
Hoxa13Q62424 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
Hoxa13Q62424 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
Hoxa13Q62424 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Hoxa13Q62424 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC20.68■□□□□ 0.9
Hoxa13Q62424 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Hoxa13Q62424 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
Hoxa13Q62424 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Hoxa13Q62424 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Hoxa13Q62424 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Hoxa13Q62424 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Hoxa13Q62424 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Hoxa13Q62424 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Hoxa13Q62424 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Hoxa13Q62424 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Hoxa13Q62424 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Hoxa13Q62424 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC20.66■□□□□ 0.9
Hoxa13Q62424 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Hoxa13Q62424 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Hoxa13Q62424 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Hoxa13Q62424 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Hoxa13Q62424 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Hoxa13Q62424 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Hoxa13Q62424 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Hoxa13Q62424 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Hoxa13Q62424 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Hoxa13Q62424 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Hoxa13Q62424 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Hoxa13Q62424 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Hoxa13Q62424 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Hoxa13Q62424 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.9
Hoxa13Q62424 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
Hoxa13Q62424 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.9
Hoxa13Q62424 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Hoxa13Q62424 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Hoxa13Q62424 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Hoxa13Q62424 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Hoxa13Q62424 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC20.64■□□□□ 0.89
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Hoxa13Q62424 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Hoxa13Q62424 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Hoxa13Q62424 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
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Hoxa13Q62424 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
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Hoxa13Q62424 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Hoxa13Q62424 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
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Hoxa13Q62424 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Hoxa13Q62424 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Hoxa13Q62424 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
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Hoxa13Q62424 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Hoxa13Q62424 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Hoxa13Q62424 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Hoxa13Q62424 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Hoxa13Q62424 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Hoxa13Q62424 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Hoxa13Q62424 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Hoxa13Q62424 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
Hoxa13Q62424 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Hoxa13Q62424 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Hoxa13Q62424 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Hoxa13Q62424 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Hoxa13Q62424 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Hoxa13Q62424 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Hoxa13Q62424 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Hoxa13Q62424 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Hoxa13Q62424 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Hoxa13Q62424 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Hoxa13Q62424 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Hoxa13Q62424 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Hoxa13Q62424 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Hoxa13Q62424 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Hoxa13Q62424 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
Hoxa13Q62424 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
Hoxa13Q62424 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
Hoxa13Q62424 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Hoxa13Q62424 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Hoxa13Q62424 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Hoxa13Q62424 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
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