Protein–RNA interactions for Protein: Q62383

Supt6h, Transcription elongation factor SPT6, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,726 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Supt6hQ62383 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Supt6hQ62383 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Supt6hQ62383 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Supt6hQ62383 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
Supt6hQ62383 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Supt6hQ62383 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
Supt6hQ62383 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
Supt6hQ62383 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Supt6hQ62383 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Supt6hQ62383 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
Supt6hQ62383 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
Supt6hQ62383 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Supt6hQ62383 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Supt6hQ62383 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC26.86■■□□□ 1.89
Supt6hQ62383 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Supt6hQ62383 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
Supt6hQ62383 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Supt6hQ62383 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
Supt6hQ62383 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Supt6hQ62383 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC26.85■■□□□ 1.89
Supt6hQ62383 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Supt6hQ62383 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Supt6hQ62383 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
Supt6hQ62383 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC26.85■■□□□ 1.89
Supt6hQ62383 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Supt6hQ62383 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
Supt6hQ62383 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Supt6hQ62383 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Supt6hQ62383 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Supt6hQ62383 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Supt6hQ62383 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Supt6hQ62383 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Supt6hQ62383 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
Supt6hQ62383 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Supt6hQ62383 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
Supt6hQ62383 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Supt6hQ62383 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.88
Supt6hQ62383 Uqcc2-203ENSMUST00000119227 452 ntTSL 3 BASIC26.82■■□□□ 1.88
Supt6hQ62383 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
Supt6hQ62383 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Supt6hQ62383 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Supt6hQ62383 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
Supt6hQ62383 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
Supt6hQ62383 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Supt6hQ62383 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Supt6hQ62383 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Supt6hQ62383 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Supt6hQ62383 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Supt6hQ62383 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
Supt6hQ62383 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
Supt6hQ62383 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
Supt6hQ62383 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Supt6hQ62383 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Supt6hQ62383 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Supt6hQ62383 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
Supt6hQ62383 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
Supt6hQ62383 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Supt6hQ62383 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Supt6hQ62383 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Supt6hQ62383 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Supt6hQ62383 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Supt6hQ62383 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC26.8■■□□□ 1.88
Supt6hQ62383 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Supt6hQ62383 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC26.8■■□□□ 1.88
Supt6hQ62383 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Supt6hQ62383 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Supt6hQ62383 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Supt6hQ62383 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
Supt6hQ62383 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Supt6hQ62383 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
Supt6hQ62383 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
Supt6hQ62383 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Supt6hQ62383 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Supt6hQ62383 Gm7461-201ENSMUST00000058918 827 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
Supt6hQ62383 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Supt6hQ62383 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
Supt6hQ62383 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
Supt6hQ62383 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Supt6hQ62383 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
Supt6hQ62383 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Supt6hQ62383 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC26.79■■□□□ 1.88
Supt6hQ62383 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Supt6hQ62383 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
Supt6hQ62383 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Supt6hQ62383 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Supt6hQ62383 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Supt6hQ62383 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Supt6hQ62383 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Supt6hQ62383 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Supt6hQ62383 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Supt6hQ62383 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Supt6hQ62383 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Supt6hQ62383 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC26.78■■□□□ 1.88
Supt6hQ62383 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Supt6hQ62383 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Supt6hQ62383 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Supt6hQ62383 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
Supt6hQ62383 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Supt6hQ62383 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Supt6hQ62383 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67.4 ms