Protein–RNA interactions for Protein: Q62132

Ptprr, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase R, mousemouse

Predictions only

Length 656 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprrQ62132 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
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PtprrQ62132 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
PtprrQ62132 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
PtprrQ62132 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
PtprrQ62132 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
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PtprrQ62132 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PtprrQ62132 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PtprrQ62132 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PtprrQ62132 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PtprrQ62132 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
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PtprrQ62132 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
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PtprrQ62132 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
PtprrQ62132 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
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PtprrQ62132 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PtprrQ62132 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
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PtprrQ62132 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PtprrQ62132 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PtprrQ62132 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
PtprrQ62132 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
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PtprrQ62132 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
PtprrQ62132 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
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PtprrQ62132 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
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PtprrQ62132 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
PtprrQ62132 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
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PtprrQ62132 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
PtprrQ62132 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
PtprrQ62132 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
PtprrQ62132 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
PtprrQ62132 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
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PtprrQ62132 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
PtprrQ62132 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
PtprrQ62132 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
PtprrQ62132 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
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PtprrQ62132 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
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PtprrQ62132 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
PtprrQ62132 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
PtprrQ62132 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
PtprrQ62132 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
PtprrQ62132 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
PtprrQ62132 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
PtprrQ62132 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
PtprrQ62132 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
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PtprrQ62132 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
PtprrQ62132 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PtprrQ62132 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
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PtprrQ62132 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PtprrQ62132 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
PtprrQ62132 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PtprrQ62132 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PtprrQ62132 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
PtprrQ62132 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PtprrQ62132 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
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