Protein–RNA interactions for Protein: Q61999

Odf1, Outer dense fiber protein 1, mousemouse

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Length 247 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Odf1Q61999 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Odf1Q61999 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Odf1Q61999 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Odf1Q61999 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
Odf1Q61999 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Odf1Q61999 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Odf1Q61999 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Odf1Q61999 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Odf1Q61999 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Odf1Q61999 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Odf1Q61999 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Odf1Q61999 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Odf1Q61999 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Odf1Q61999 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Odf1Q61999 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Odf1Q61999 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Odf1Q61999 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC13.77□□□□□ -0.21
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Odf1Q61999 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Odf1Q61999 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Odf1Q61999 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Odf1Q61999 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
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Odf1Q61999 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Odf1Q61999 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Odf1Q61999 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Odf1Q61999 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Odf1Q61999 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Odf1Q61999 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Odf1Q61999 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Odf1Q61999 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Odf1Q61999 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Odf1Q61999 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Odf1Q61999 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
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Odf1Q61999 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Odf1Q61999 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Odf1Q61999 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
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Odf1Q61999 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Odf1Q61999 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Odf1Q61999 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Odf1Q61999 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Odf1Q61999 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
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Odf1Q61999 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
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Odf1Q61999 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Odf1Q61999 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
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Odf1Q61999 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
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Odf1Q61999 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Odf1Q61999 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Odf1Q61999 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Odf1Q61999 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Odf1Q61999 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
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Odf1Q61999 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Odf1Q61999 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Odf1Q61999 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Odf1Q61999 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Odf1Q61999 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Odf1Q61999 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Odf1Q61999 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Odf1Q61999 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Odf1Q61999 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Odf1Q61999 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Odf1Q61999 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Odf1Q61999 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Odf1Q61999 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Odf1Q61999 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Odf1Q61999 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Odf1Q61999 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Odf1Q61999 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Odf1Q61999 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
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