Protein–RNA interactions for Protein: Q61409

Pde3b, cGMP-inhibited 3',5'-cyclic phosphodiesterase B, mousemouse

Predictions only

Length 1,100 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pde3bQ61409 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Pde3bQ61409 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Pde3bQ61409 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Pde3bQ61409 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Pde3bQ61409 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Pde3bQ61409 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Pde3bQ61409 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Pde3bQ61409 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Pde3bQ61409 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Pde3bQ61409 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Pde3bQ61409 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Pde3bQ61409 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Pde3bQ61409 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Pde3bQ61409 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Pde3bQ61409 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Pde3bQ61409 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Pde3bQ61409 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Pde3bQ61409 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Pde3bQ61409 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Pde3bQ61409 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Pde3bQ61409 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Pde3bQ61409 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Pde3bQ61409 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Pde3bQ61409 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Pde3bQ61409 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Pde3bQ61409 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Pde3bQ61409 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Pde3bQ61409 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Pde3bQ61409 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Pde3bQ61409 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Pde3bQ61409 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Pde3bQ61409 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Pde3bQ61409 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Pde3bQ61409 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Pde3bQ61409 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Pde3bQ61409 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Pde3bQ61409 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Pde3bQ61409 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Pde3bQ61409 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Pde3bQ61409 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Pde3bQ61409 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Pde3bQ61409 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Pde3bQ61409 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Pde3bQ61409 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Pde3bQ61409 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Pde3bQ61409 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Pde3bQ61409 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Pde3bQ61409 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Pde3bQ61409 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Pde3bQ61409 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Pde3bQ61409 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Pde3bQ61409 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Pde3bQ61409 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Pde3bQ61409 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Pde3bQ61409 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Pde3bQ61409 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Pde3bQ61409 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Pde3bQ61409 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Pde3bQ61409 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Pde3bQ61409 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Pde3bQ61409 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Pde3bQ61409 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Pde3bQ61409 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Pde3bQ61409 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Pde3bQ61409 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Pde3bQ61409 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Pde3bQ61409 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Pde3bQ61409 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Pde3bQ61409 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Pde3bQ61409 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Pde3bQ61409 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Pde3bQ61409 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Pde3bQ61409 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Pde3bQ61409 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Pde3bQ61409 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Pde3bQ61409 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Pde3bQ61409 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Pde3bQ61409 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Pde3bQ61409 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Pde3bQ61409 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Pde3bQ61409 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Pde3bQ61409 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Pde3bQ61409 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Pde3bQ61409 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Pde3bQ61409 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Pde3bQ61409 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Pde3bQ61409 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Pde3bQ61409 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Pde3bQ61409 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Pde3bQ61409 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Pde3bQ61409 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Pde3bQ61409 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Pde3bQ61409 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Pde3bQ61409 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Pde3bQ61409 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Pde3bQ61409 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Pde3bQ61409 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Pde3bQ61409 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Pde3bQ61409 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Pde3bQ61409 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.9 ms