Protein–RNA interactions for Protein: Q61313

Tfap2b, Transcription factor AP-2-beta, mousemouse

Predictions only

Length 459 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tfap2bQ61313 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Tfap2bQ61313 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Tfap2bQ61313 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Tfap2bQ61313 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Tfap2bQ61313 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Tfap2bQ61313 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Tfap2bQ61313 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Tfap2bQ61313 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Tfap2bQ61313 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Tfap2bQ61313 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Tfap2bQ61313 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Tfap2bQ61313 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Tfap2bQ61313 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Tfap2bQ61313 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Tfap2bQ61313 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Tfap2bQ61313 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Tfap2bQ61313 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Tfap2bQ61313 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Tfap2bQ61313 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Tfap2bQ61313 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Tfap2bQ61313 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Tfap2bQ61313 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Tfap2bQ61313 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Tfap2bQ61313 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Tfap2bQ61313 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Tfap2bQ61313 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
Tfap2bQ61313 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Tfap2bQ61313 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Tfap2bQ61313 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Tfap2bQ61313 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Tfap2bQ61313 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Tfap2bQ61313 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Tfap2bQ61313 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Tfap2bQ61313 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Tfap2bQ61313 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Tfap2bQ61313 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Tfap2bQ61313 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Tfap2bQ61313 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Tfap2bQ61313 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Tfap2bQ61313 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Tfap2bQ61313 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Tfap2bQ61313 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Tfap2bQ61313 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Tfap2bQ61313 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Tfap2bQ61313 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
Tfap2bQ61313 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Tfap2bQ61313 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Tfap2bQ61313 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Tfap2bQ61313 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Tfap2bQ61313 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Tfap2bQ61313 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Tfap2bQ61313 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Tfap2bQ61313 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Tfap2bQ61313 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Tfap2bQ61313 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Tfap2bQ61313 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Tfap2bQ61313 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Tfap2bQ61313 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Tfap2bQ61313 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Tfap2bQ61313 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Tfap2bQ61313 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Tfap2bQ61313 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Tfap2bQ61313 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Tfap2bQ61313 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Tfap2bQ61313 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Tfap2bQ61313 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Tfap2bQ61313 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Tfap2bQ61313 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
Tfap2bQ61313 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Tfap2bQ61313 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Tfap2bQ61313 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Tfap2bQ61313 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Tfap2bQ61313 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Tfap2bQ61313 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Tfap2bQ61313 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Tfap2bQ61313 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Tfap2bQ61313 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Tfap2bQ61313 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Tfap2bQ61313 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Tfap2bQ61313 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Tfap2bQ61313 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Tfap2bQ61313 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Tfap2bQ61313 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Tfap2bQ61313 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Tfap2bQ61313 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Tfap2bQ61313 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Tfap2bQ61313 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Tfap2bQ61313 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Tfap2bQ61313 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Tfap2bQ61313 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Tfap2bQ61313 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Tfap2bQ61313 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Tfap2bQ61313 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Tfap2bQ61313 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Tfap2bQ61313 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Tfap2bQ61313 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Tfap2bQ61313 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Tfap2bQ61313 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Tfap2bQ61313 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Tfap2bQ61313 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.1 ms