Protein–RNA interactions for Protein: Q61290

Cacna1e, Voltage-dependent R-type calcium channel subunit alpha-1E, mousemouse

Predictions only

Length 2,272 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cacna1eQ61290 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cacna1eQ61290 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cacna1eQ61290 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Cacna1eQ61290 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cacna1eQ61290 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Cacna1eQ61290 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cacna1eQ61290 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Cacna1eQ61290 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cacna1eQ61290 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cacna1eQ61290 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cacna1eQ61290 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cacna1eQ61290 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cacna1eQ61290 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cacna1eQ61290 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Cacna1eQ61290 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cacna1eQ61290 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Cacna1eQ61290 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Cacna1eQ61290 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cacna1eQ61290 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cacna1eQ61290 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cacna1eQ61290 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cacna1eQ61290 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cacna1eQ61290 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cacna1eQ61290 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cacna1eQ61290 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cacna1eQ61290 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cacna1eQ61290 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Cacna1eQ61290 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Cacna1eQ61290 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Cacna1eQ61290 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Cacna1eQ61290 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Cacna1eQ61290 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Cacna1eQ61290 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Cacna1eQ61290 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Cacna1eQ61290 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Cacna1eQ61290 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Cacna1eQ61290 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Cacna1eQ61290 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Cacna1eQ61290 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Cacna1eQ61290 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Cacna1eQ61290 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cacna1eQ61290 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cacna1eQ61290 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Cacna1eQ61290 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cacna1eQ61290 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cacna1eQ61290 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cacna1eQ61290 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cacna1eQ61290 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cacna1eQ61290 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cacna1eQ61290 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cacna1eQ61290 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cacna1eQ61290 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cacna1eQ61290 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cacna1eQ61290 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cacna1eQ61290 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cacna1eQ61290 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cacna1eQ61290 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cacna1eQ61290 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cacna1eQ61290 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cacna1eQ61290 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cacna1eQ61290 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Cacna1eQ61290 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cacna1eQ61290 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cacna1eQ61290 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cacna1eQ61290 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cacna1eQ61290 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cacna1eQ61290 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cacna1eQ61290 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cacna1eQ61290 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cacna1eQ61290 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cacna1eQ61290 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cacna1eQ61290 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cacna1eQ61290 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cacna1eQ61290 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cacna1eQ61290 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cacna1eQ61290 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cacna1eQ61290 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cacna1eQ61290 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cacna1eQ61290 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cacna1eQ61290 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cacna1eQ61290 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cacna1eQ61290 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cacna1eQ61290 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cacna1eQ61290 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cacna1eQ61290 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cacna1eQ61290 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cacna1eQ61290 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cacna1eQ61290 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cacna1eQ61290 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cacna1eQ61290 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cacna1eQ61290 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cacna1eQ61290 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cacna1eQ61290 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cacna1eQ61290 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cacna1eQ61290 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Cacna1eQ61290 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cacna1eQ61290 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cacna1eQ61290 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cacna1eQ61290 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cacna1eQ61290 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.3 ms