Protein–RNA interactions for Protein: Q61191

Hcfc1, Host cell factor 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,045 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hcfc1Q61191 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hcfc1Q61191 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hcfc1Q61191 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hcfc1Q61191 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Hcfc1Q61191 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Hcfc1Q61191 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hcfc1Q61191 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hcfc1Q61191 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hcfc1Q61191 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hcfc1Q61191 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hcfc1Q61191 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hcfc1Q61191 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hcfc1Q61191 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hcfc1Q61191 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Hcfc1Q61191 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hcfc1Q61191 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hcfc1Q61191 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Hcfc1Q61191 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hcfc1Q61191 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hcfc1Q61191 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hcfc1Q61191 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hcfc1Q61191 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hcfc1Q61191 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hcfc1Q61191 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hcfc1Q61191 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hcfc1Q61191 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hcfc1Q61191 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Hcfc1Q61191 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hcfc1Q61191 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hcfc1Q61191 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hcfc1Q61191 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hcfc1Q61191 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hcfc1Q61191 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hcfc1Q61191 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hcfc1Q61191 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hcfc1Q61191 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hcfc1Q61191 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hcfc1Q61191 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hcfc1Q61191 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hcfc1Q61191 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hcfc1Q61191 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hcfc1Q61191 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hcfc1Q61191 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hcfc1Q61191 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Hcfc1Q61191 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Hcfc1Q61191 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Hcfc1Q61191 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Hcfc1Q61191 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Hcfc1Q61191 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Hcfc1Q61191 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Hcfc1Q61191 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Hcfc1Q61191 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Hcfc1Q61191 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Hcfc1Q61191 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Hcfc1Q61191 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Hcfc1Q61191 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Hcfc1Q61191 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Hcfc1Q61191 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Hcfc1Q61191 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Hcfc1Q61191 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Hcfc1Q61191 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Hcfc1Q61191 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Hcfc1Q61191 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Hcfc1Q61191 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Hcfc1Q61191 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Hcfc1Q61191 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Hcfc1Q61191 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Hcfc1Q61191 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Hcfc1Q61191 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Hcfc1Q61191 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Hcfc1Q61191 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Hcfc1Q61191 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Hcfc1Q61191 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Hcfc1Q61191 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Hcfc1Q61191 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Hcfc1Q61191 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Hcfc1Q61191 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Hcfc1Q61191 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Hcfc1Q61191 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Hcfc1Q61191 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Hcfc1Q61191 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Hcfc1Q61191 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Hcfc1Q61191 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Hcfc1Q61191 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Hcfc1Q61191 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hcfc1Q61191 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hcfc1Q61191 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hcfc1Q61191 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hcfc1Q61191 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hcfc1Q61191 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hcfc1Q61191 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hcfc1Q61191 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hcfc1Q61191 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hcfc1Q61191 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hcfc1Q61191 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hcfc1Q61191 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hcfc1Q61191 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hcfc1Q61191 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hcfc1Q61191 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hcfc1Q61191 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.2 ms