Protein–RNA interactions for Protein: Q61080

Foxf1, Forkhead box protein F1, mousemouse

Predictions only

Length 378 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Foxf1Q61080 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Foxf1Q61080 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Foxf1Q61080 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Foxf1Q61080 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Foxf1Q61080 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Foxf1Q61080 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Foxf1Q61080 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Foxf1Q61080 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Foxf1Q61080 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Foxf1Q61080 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Foxf1Q61080 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Foxf1Q61080 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Foxf1Q61080 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Foxf1Q61080 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Foxf1Q61080 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Foxf1Q61080 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Foxf1Q61080 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Foxf1Q61080 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Foxf1Q61080 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Foxf1Q61080 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Foxf1Q61080 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Foxf1Q61080 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Foxf1Q61080 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Foxf1Q61080 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Foxf1Q61080 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Foxf1Q61080 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Foxf1Q61080 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Foxf1Q61080 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Foxf1Q61080 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Foxf1Q61080 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Foxf1Q61080 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Foxf1Q61080 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Foxf1Q61080 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Foxf1Q61080 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Foxf1Q61080 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Foxf1Q61080 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Foxf1Q61080 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Foxf1Q61080 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Foxf1Q61080 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Foxf1Q61080 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Foxf1Q61080 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Foxf1Q61080 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Foxf1Q61080 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Foxf1Q61080 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Foxf1Q61080 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Foxf1Q61080 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Foxf1Q61080 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Foxf1Q61080 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Foxf1Q61080 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Foxf1Q61080 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Foxf1Q61080 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Foxf1Q61080 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Foxf1Q61080 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Foxf1Q61080 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Foxf1Q61080 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Foxf1Q61080 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Foxf1Q61080 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Foxf1Q61080 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Foxf1Q61080 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Foxf1Q61080 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Foxf1Q61080 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Foxf1Q61080 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Foxf1Q61080 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Foxf1Q61080 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Foxf1Q61080 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Foxf1Q61080 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Foxf1Q61080 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Foxf1Q61080 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Foxf1Q61080 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Foxf1Q61080 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Foxf1Q61080 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Foxf1Q61080 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Foxf1Q61080 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Foxf1Q61080 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Foxf1Q61080 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Foxf1Q61080 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Foxf1Q61080 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Foxf1Q61080 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Foxf1Q61080 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Foxf1Q61080 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Foxf1Q61080 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Foxf1Q61080 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Foxf1Q61080 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Foxf1Q61080 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Foxf1Q61080 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Foxf1Q61080 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Foxf1Q61080 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Foxf1Q61080 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Foxf1Q61080 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Foxf1Q61080 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Foxf1Q61080 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Foxf1Q61080 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Foxf1Q61080 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Foxf1Q61080 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Foxf1Q61080 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Foxf1Q61080 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Foxf1Q61080 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Foxf1Q61080 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Foxf1Q61080 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Foxf1Q61080 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31 ms