Protein–RNA interactions for Protein: Q61056

Trpc1, Short transient receptor potential channel 1, mousemouse

Predictions only

Length 793 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trpc1Q61056 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Trpc1Q61056 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Trpc1Q61056 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Trpc1Q61056 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Trpc1Q61056 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Trpc1Q61056 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Trpc1Q61056 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Trpc1Q61056 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Trpc1Q61056 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Trpc1Q61056 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Trpc1Q61056 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Trpc1Q61056 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Trpc1Q61056 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Trpc1Q61056 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Trpc1Q61056 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Trpc1Q61056 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Trpc1Q61056 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Trpc1Q61056 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Trpc1Q61056 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Trpc1Q61056 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Trpc1Q61056 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Trpc1Q61056 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Trpc1Q61056 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Trpc1Q61056 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Trpc1Q61056 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Trpc1Q61056 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Trpc1Q61056 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Trpc1Q61056 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Trpc1Q61056 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Trpc1Q61056 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Trpc1Q61056 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Trpc1Q61056 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Trpc1Q61056 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Trpc1Q61056 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Trpc1Q61056 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Trpc1Q61056 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Trpc1Q61056 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Trpc1Q61056 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Trpc1Q61056 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Trpc1Q61056 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Trpc1Q61056 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Trpc1Q61056 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Trpc1Q61056 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Trpc1Q61056 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Trpc1Q61056 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Trpc1Q61056 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Trpc1Q61056 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Trpc1Q61056 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Trpc1Q61056 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Trpc1Q61056 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Trpc1Q61056 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Trpc1Q61056 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Trpc1Q61056 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Trpc1Q61056 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Trpc1Q61056 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Trpc1Q61056 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Trpc1Q61056 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Trpc1Q61056 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Trpc1Q61056 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Trpc1Q61056 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Trpc1Q61056 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Trpc1Q61056 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Trpc1Q61056 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Trpc1Q61056 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Trpc1Q61056 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Trpc1Q61056 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Trpc1Q61056 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Trpc1Q61056 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Trpc1Q61056 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Trpc1Q61056 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Trpc1Q61056 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Trpc1Q61056 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Trpc1Q61056 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Trpc1Q61056 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Trpc1Q61056 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Trpc1Q61056 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Trpc1Q61056 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Trpc1Q61056 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Trpc1Q61056 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Trpc1Q61056 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Trpc1Q61056 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Trpc1Q61056 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Trpc1Q61056 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Trpc1Q61056 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Trpc1Q61056 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Trpc1Q61056 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Trpc1Q61056 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Trpc1Q61056 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Trpc1Q61056 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Trpc1Q61056 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Trpc1Q61056 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Trpc1Q61056 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Trpc1Q61056 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Trpc1Q61056 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Trpc1Q61056 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Trpc1Q61056 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Trpc1Q61056 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Trpc1Q61056 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Trpc1Q61056 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Trpc1Q61056 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.1 ms