Protein–RNA interactions for Protein: Q60973

Rbbp7, Histone-binding protein RBBP7, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 425 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbbp7Q60973 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rbbp7Q60973 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Rbbp7Q60973 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rbbp7Q60973 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Rbbp7Q60973 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rbbp7Q60973 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rbbp7Q60973 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rbbp7Q60973 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rbbp7Q60973 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rbbp7Q60973 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rbbp7Q60973 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rbbp7Q60973 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rbbp7Q60973 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rbbp7Q60973 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Rbbp7Q60973 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rbbp7Q60973 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rbbp7Q60973 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rbbp7Q60973 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rbbp7Q60973 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Rbbp7Q60973 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rbbp7Q60973 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rbbp7Q60973 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rbbp7Q60973 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rbbp7Q60973 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rbbp7Q60973 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rbbp7Q60973 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rbbp7Q60973 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rbbp7Q60973 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rbbp7Q60973 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rbbp7Q60973 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rbbp7Q60973 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Rbbp7Q60973 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Rbbp7Q60973 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Rbbp7Q60973 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Rbbp7Q60973 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Rbbp7Q60973 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Rbbp7Q60973 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Rbbp7Q60973 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Rbbp7Q60973 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Rbbp7Q60973 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Rbbp7Q60973 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Rbbp7Q60973 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Rbbp7Q60973 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Rbbp7Q60973 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Rbbp7Q60973 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Rbbp7Q60973 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rbbp7Q60973 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rbbp7Q60973 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rbbp7Q60973 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rbbp7Q60973 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rbbp7Q60973 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rbbp7Q60973 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rbbp7Q60973 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rbbp7Q60973 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rbbp7Q60973 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rbbp7Q60973 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rbbp7Q60973 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rbbp7Q60973 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rbbp7Q60973 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rbbp7Q60973 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rbbp7Q60973 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rbbp7Q60973 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rbbp7Q60973 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Rbbp7Q60973 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Rbbp7Q60973 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Rbbp7Q60973 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Rbbp7Q60973 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Rbbp7Q60973 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Rbbp7Q60973 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Rbbp7Q60973 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Rbbp7Q60973 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Rbbp7Q60973 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Rbbp7Q60973 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Rbbp7Q60973 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Rbbp7Q60973 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Rbbp7Q60973 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Rbbp7Q60973 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Rbbp7Q60973 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Rbbp7Q60973 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rbbp7Q60973 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Rbbp7Q60973 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rbbp7Q60973 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rbbp7Q60973 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rbbp7Q60973 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Rbbp7Q60973 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rbbp7Q60973 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rbbp7Q60973 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rbbp7Q60973 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rbbp7Q60973 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rbbp7Q60973 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rbbp7Q60973 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rbbp7Q60973 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rbbp7Q60973 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rbbp7Q60973 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rbbp7Q60973 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rbbp7Q60973 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rbbp7Q60973 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rbbp7Q60973 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rbbp7Q60973 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rbbp7Q60973 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.7 ms