Protein–RNA interactions for Protein: Q60961

Laptm4a, Lysosomal-associated transmembrane protein 4A, mousemouse

Predictions only

Length 233 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Laptm4aQ60961 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Laptm4aQ60961 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Laptm4aQ60961 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Laptm4aQ60961 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Laptm4aQ60961 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Laptm4aQ60961 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Laptm4aQ60961 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Laptm4aQ60961 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Laptm4aQ60961 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Laptm4aQ60961 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Laptm4aQ60961 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Laptm4aQ60961 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Laptm4aQ60961 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Laptm4aQ60961 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Laptm4aQ60961 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Laptm4aQ60961 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Laptm4aQ60961 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Laptm4aQ60961 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Laptm4aQ60961 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Laptm4aQ60961 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Laptm4aQ60961 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Laptm4aQ60961 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Laptm4aQ60961 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Laptm4aQ60961 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Laptm4aQ60961 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Laptm4aQ60961 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Laptm4aQ60961 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Laptm4aQ60961 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Laptm4aQ60961 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Laptm4aQ60961 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Laptm4aQ60961 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Laptm4aQ60961 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Laptm4aQ60961 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Laptm4aQ60961 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Laptm4aQ60961 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Laptm4aQ60961 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Laptm4aQ60961 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Laptm4aQ60961 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Laptm4aQ60961 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Laptm4aQ60961 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Laptm4aQ60961 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Laptm4aQ60961 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Laptm4aQ60961 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Laptm4aQ60961 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Laptm4aQ60961 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Laptm4aQ60961 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Laptm4aQ60961 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Laptm4aQ60961 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Laptm4aQ60961 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Laptm4aQ60961 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Laptm4aQ60961 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Laptm4aQ60961 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Laptm4aQ60961 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Laptm4aQ60961 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Laptm4aQ60961 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Laptm4aQ60961 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Laptm4aQ60961 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Laptm4aQ60961 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Laptm4aQ60961 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Laptm4aQ60961 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Laptm4aQ60961 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Laptm4aQ60961 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Laptm4aQ60961 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Laptm4aQ60961 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Laptm4aQ60961 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Laptm4aQ60961 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Laptm4aQ60961 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Laptm4aQ60961 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Laptm4aQ60961 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Laptm4aQ60961 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Laptm4aQ60961 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Laptm4aQ60961 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Laptm4aQ60961 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Laptm4aQ60961 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Laptm4aQ60961 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Laptm4aQ60961 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Laptm4aQ60961 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Laptm4aQ60961 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Laptm4aQ60961 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Laptm4aQ60961 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Laptm4aQ60961 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Laptm4aQ60961 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Laptm4aQ60961 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Laptm4aQ60961 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Laptm4aQ60961 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Laptm4aQ60961 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Laptm4aQ60961 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Laptm4aQ60961 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Laptm4aQ60961 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Laptm4aQ60961 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Laptm4aQ60961 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Laptm4aQ60961 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Laptm4aQ60961 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Laptm4aQ60961 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Laptm4aQ60961 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Laptm4aQ60961 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Laptm4aQ60961 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Laptm4aQ60961 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Laptm4aQ60961 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Laptm4aQ60961 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.8 ms