Protein–RNA interactions for Protein: Q60829

Ppp1r1b, Protein phosphatase 1 regulatory subunit 1B, mousemouse

Predictions only

Length 194 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ppp1r1bQ60829 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Ppp1r1bQ60829 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ppp1r1bQ60829 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ppp1r1bQ60829 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Ppp1r1bQ60829 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ppp1r1bQ60829 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ppp1r1bQ60829 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Ppp1r1bQ60829 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ppp1r1bQ60829 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ppp1r1bQ60829 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Ppp1r1bQ60829 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Ppp1r1bQ60829 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Ppp1r1bQ60829 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Ppp1r1bQ60829 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Ppp1r1bQ60829 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Ppp1r1bQ60829 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ppp1r1bQ60829 Gm37935-201ENSMUST00000192012 982 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Ppp1r1bQ60829 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ppp1r1bQ60829 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ppp1r1bQ60829 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ppp1r1bQ60829 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Ppp1r1bQ60829 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ppp1r1bQ60829 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ppp1r1bQ60829 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ppp1r1bQ60829 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ppp1r1bQ60829 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ppp1r1bQ60829 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ppp1r1bQ60829 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ppp1r1bQ60829 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Ppp1r1bQ60829 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ppp1r1bQ60829 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ppp1r1bQ60829 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ppp1r1bQ60829 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ppp1r1bQ60829 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Ppp1r1bQ60829 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Ppp1r1bQ60829 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Ppp1r1bQ60829 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
Ppp1r1bQ60829 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Ppp1r1bQ60829 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Ppp1r1bQ60829 Lhx1os-201ENSMUST00000126072 589 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
Ppp1r1bQ60829 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Ppp1r1bQ60829 Gm26756-201ENSMUST00000181689 1294 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Ppp1r1bQ60829 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
Ppp1r1bQ60829 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Ppp1r1bQ60829 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Ppp1r1bQ60829 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Ppp1r1bQ60829 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Ppp1r1bQ60829 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Ppp1r1bQ60829 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Ppp1r1bQ60829 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Ppp1r1bQ60829 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ppp1r1bQ60829 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ppp1r1bQ60829 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ppp1r1bQ60829 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ppp1r1bQ60829 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Ppp1r1bQ60829 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ppp1r1bQ60829 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ppp1r1bQ60829 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ppp1r1bQ60829 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ppp1r1bQ60829 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ppp1r1bQ60829 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ppp1r1bQ60829 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ppp1r1bQ60829 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ppp1r1bQ60829 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ppp1r1bQ60829 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ppp1r1bQ60829 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ppp1r1bQ60829 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ppp1r1bQ60829 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ppp1r1bQ60829 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ppp1r1bQ60829 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ppp1r1bQ60829 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ppp1r1bQ60829 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ppp1r1bQ60829 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ppp1r1bQ60829 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ppp1r1bQ60829 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ppp1r1bQ60829 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ppp1r1bQ60829 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ppp1r1bQ60829 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Ppp1r1bQ60829 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ppp1r1bQ60829 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ppp1r1bQ60829 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ppp1r1bQ60829 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ppp1r1bQ60829 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ppp1r1bQ60829 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ppp1r1bQ60829 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Ppp1r1bQ60829 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ppp1r1bQ60829 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ppp1r1bQ60829 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ppp1r1bQ60829 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ppp1r1bQ60829 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ppp1r1bQ60829 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ppp1r1bQ60829 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ppp1r1bQ60829 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ppp1r1bQ60829 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ppp1r1bQ60829 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ppp1r1bQ60829 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
Ppp1r1bQ60829 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ppp1r1bQ60829 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
Ppp1r1bQ60829 Mrps18a-201ENSMUST00000024763 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ppp1r1bQ60829 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.7 ms