Protein–RNA interactions for Protein: Q60803

Traf3, TNF receptor-associated factor 3, mousemouse

Predictions only

Length 567 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Traf3Q60803 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Traf3Q60803 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
Traf3Q60803 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
Traf3Q60803 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Traf3Q60803 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Traf3Q60803 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Traf3Q60803 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Traf3Q60803 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Traf3Q60803 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Traf3Q60803 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Traf3Q60803 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Traf3Q60803 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Traf3Q60803 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Traf3Q60803 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Traf3Q60803 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Traf3Q60803 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Traf3Q60803 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Traf3Q60803 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Traf3Q60803 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Traf3Q60803 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Traf3Q60803 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Traf3Q60803 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Traf3Q60803 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Traf3Q60803 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Traf3Q60803 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Traf3Q60803 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Traf3Q60803 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Traf3Q60803 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Traf3Q60803 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Traf3Q60803 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
Traf3Q60803 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Traf3Q60803 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Traf3Q60803 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Traf3Q60803 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Traf3Q60803 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Traf3Q60803 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
Traf3Q60803 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Traf3Q60803 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
Traf3Q60803 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Traf3Q60803 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Traf3Q60803 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Traf3Q60803 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Traf3Q60803 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Traf3Q60803 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Traf3Q60803 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
Traf3Q60803 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Traf3Q60803 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Traf3Q60803 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Traf3Q60803 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Traf3Q60803 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
Traf3Q60803 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Traf3Q60803 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Traf3Q60803 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Traf3Q60803 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Traf3Q60803 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Traf3Q60803 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Traf3Q60803 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Traf3Q60803 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
Traf3Q60803 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Traf3Q60803 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Traf3Q60803 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Traf3Q60803 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Traf3Q60803 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Traf3Q60803 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Traf3Q60803 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Traf3Q60803 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Traf3Q60803 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Traf3Q60803 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Traf3Q60803 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Traf3Q60803 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Traf3Q60803 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Traf3Q60803 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Traf3Q60803 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Traf3Q60803 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Traf3Q60803 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Traf3Q60803 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Traf3Q60803 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Traf3Q60803 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Traf3Q60803 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Traf3Q60803 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Traf3Q60803 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Traf3Q60803 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Traf3Q60803 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Traf3Q60803 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Traf3Q60803 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Traf3Q60803 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Traf3Q60803 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Traf3Q60803 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Traf3Q60803 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
Traf3Q60803 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Traf3Q60803 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Traf3Q60803 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Traf3Q60803 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Traf3Q60803 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Traf3Q60803 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Traf3Q60803 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Traf3Q60803 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Traf3Q60803 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Traf3Q60803 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Traf3Q60803 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.6 ms