Protein–RNA interactions for Protein: Q60770

Stxbp3, Syntaxin-binding protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 592 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stxbp3Q60770 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Stxbp3Q60770 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Stxbp3Q60770 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Stxbp3Q60770 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Stxbp3Q60770 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Stxbp3Q60770 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Stxbp3Q60770 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Stxbp3Q60770 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Stxbp3Q60770 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
Stxbp3Q60770 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Stxbp3Q60770 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Stxbp3Q60770 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Stxbp3Q60770 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Stxbp3Q60770 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Stxbp3Q60770 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Stxbp3Q60770 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Stxbp3Q60770 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Stxbp3Q60770 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Stxbp3Q60770 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Stxbp3Q60770 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Stxbp3Q60770 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Stxbp3Q60770 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Stxbp3Q60770 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Stxbp3Q60770 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Stxbp3Q60770 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
Stxbp3Q60770 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Stxbp3Q60770 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
Stxbp3Q60770 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Stxbp3Q60770 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Stxbp3Q60770 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Stxbp3Q60770 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Stxbp3Q60770 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Stxbp3Q60770 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Stxbp3Q60770 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Stxbp3Q60770 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Stxbp3Q60770 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Stxbp3Q60770 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Stxbp3Q60770 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Stxbp3Q60770 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Stxbp3Q60770 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Stxbp3Q60770 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Stxbp3Q60770 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Stxbp3Q60770 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Stxbp3Q60770 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Stxbp3Q60770 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Stxbp3Q60770 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Stxbp3Q60770 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Stxbp3Q60770 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Stxbp3Q60770 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Stxbp3Q60770 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
Stxbp3Q60770 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
Stxbp3Q60770 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Stxbp3Q60770 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Stxbp3Q60770 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Stxbp3Q60770 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Stxbp3Q60770 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Stxbp3Q60770 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Stxbp3Q60770 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Stxbp3Q60770 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Stxbp3Q60770 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Stxbp3Q60770 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Stxbp3Q60770 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Stxbp3Q60770 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Stxbp3Q60770 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
Stxbp3Q60770 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Stxbp3Q60770 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Stxbp3Q60770 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Stxbp3Q60770 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Stxbp3Q60770 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Stxbp3Q60770 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
Stxbp3Q60770 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Stxbp3Q60770 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Stxbp3Q60770 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Stxbp3Q60770 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Stxbp3Q60770 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Stxbp3Q60770 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Stxbp3Q60770 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Stxbp3Q60770 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Stxbp3Q60770 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Stxbp3Q60770 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
Stxbp3Q60770 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Stxbp3Q60770 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Stxbp3Q60770 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Stxbp3Q60770 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Stxbp3Q60770 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Stxbp3Q60770 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
Stxbp3Q60770 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Stxbp3Q60770 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Stxbp3Q60770 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Stxbp3Q60770 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Stxbp3Q60770 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Stxbp3Q60770 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Stxbp3Q60770 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Stxbp3Q60770 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Stxbp3Q60770 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Stxbp3Q60770 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Stxbp3Q60770 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Stxbp3Q60770 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Stxbp3Q60770 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Stxbp3Q60770 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.2 ms