Protein–RNA interactions for Protein: Q60765

Atf3, Cyclic AMP-dependent transcription factor ATF-3, mousemouse

Predictions only

Length 181 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atf3Q60765 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Atf3Q60765 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Atf3Q60765 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Atf3Q60765 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Atf3Q60765 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Atf3Q60765 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Atf3Q60765 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Atf3Q60765 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Atf3Q60765 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Atf3Q60765 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Atf3Q60765 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Atf3Q60765 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Atf3Q60765 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Atf3Q60765 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Atf3Q60765 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Atf3Q60765 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Atf3Q60765 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
Atf3Q60765 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Atf3Q60765 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Atf3Q60765 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Atf3Q60765 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Atf3Q60765 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Atf3Q60765 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Atf3Q60765 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Atf3Q60765 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Atf3Q60765 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Atf3Q60765 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Atf3Q60765 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Atf3Q60765 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Atf3Q60765 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
Atf3Q60765 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Atf3Q60765 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Atf3Q60765 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Atf3Q60765 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC24.7■■□□□ 1.55
Atf3Q60765 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Atf3Q60765 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Atf3Q60765 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
Atf3Q60765 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Atf3Q60765 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Atf3Q60765 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Atf3Q60765 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Atf3Q60765 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Atf3Q60765 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Atf3Q60765 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Atf3Q60765 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Atf3Q60765 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Atf3Q60765 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Atf3Q60765 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Atf3Q60765 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Atf3Q60765 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Atf3Q60765 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Atf3Q60765 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
Atf3Q60765 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Atf3Q60765 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Atf3Q60765 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Atf3Q60765 Uqcc2-203ENSMUST00000119227 452 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Atf3Q60765 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Atf3Q60765 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Atf3Q60765 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Atf3Q60765 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Atf3Q60765 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Atf3Q60765 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Atf3Q60765 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Atf3Q60765 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Atf3Q60765 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Atf3Q60765 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Atf3Q60765 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Atf3Q60765 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
Atf3Q60765 AC133598.3-202ENSMUST00000224219 531 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
Atf3Q60765 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Atf3Q60765 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Atf3Q60765 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Atf3Q60765 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Atf3Q60765 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Atf3Q60765 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Atf3Q60765 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Atf3Q60765 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Atf3Q60765 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Atf3Q60765 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Atf3Q60765 Gm31727-201ENSMUST00000210102 360 ntTSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Atf3Q60765 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Atf3Q60765 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Atf3Q60765 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Atf3Q60765 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Atf3Q60765 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Atf3Q60765 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
Atf3Q60765 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Atf3Q60765 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Atf3Q60765 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Atf3Q60765 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Atf3Q60765 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Atf3Q60765 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Atf3Q60765 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
Atf3Q60765 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Atf3Q60765 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Atf3Q60765 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Atf3Q60765 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Atf3Q60765 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Atf3Q60765 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Atf3Q60765 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.9 ms