Protein–RNA interactions for Protein: Q60670

Sik1, Serine/threonine-protein kinase SIK1, mousemouse

Predictions only

Length 779 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sik1Q60670 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Sik1Q60670 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Sik1Q60670 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Sik1Q60670 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Sik1Q60670 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Sik1Q60670 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Sik1Q60670 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Sik1Q60670 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Sik1Q60670 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
Sik1Q60670 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Sik1Q60670 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Sik1Q60670 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Sik1Q60670 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Sik1Q60670 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Sik1Q60670 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Sik1Q60670 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Sik1Q60670 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Sik1Q60670 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Sik1Q60670 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Sik1Q60670 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
Sik1Q60670 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Sik1Q60670 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Sik1Q60670 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Sik1Q60670 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Sik1Q60670 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Sik1Q60670 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Sik1Q60670 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Sik1Q60670 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
Sik1Q60670 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Sik1Q60670 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
Sik1Q60670 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
Sik1Q60670 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Sik1Q60670 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Sik1Q60670 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Sik1Q60670 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Sik1Q60670 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Sik1Q60670 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Sik1Q60670 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Sik1Q60670 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Sik1Q60670 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Sik1Q60670 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Sik1Q60670 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
Sik1Q60670 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Sik1Q60670 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Sik1Q60670 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Sik1Q60670 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Sik1Q60670 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Sik1Q60670 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Sik1Q60670 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Sik1Q60670 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Sik1Q60670 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Sik1Q60670 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Sik1Q60670 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Sik1Q60670 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Sik1Q60670 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Sik1Q60670 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Sik1Q60670 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Sik1Q60670 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Sik1Q60670 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Sik1Q60670 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
Sik1Q60670 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
Sik1Q60670 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Sik1Q60670 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Sik1Q60670 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Sik1Q60670 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Sik1Q60670 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Sik1Q60670 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Sik1Q60670 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Sik1Q60670 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Sik1Q60670 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Sik1Q60670 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Sik1Q60670 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Sik1Q60670 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Sik1Q60670 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Sik1Q60670 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Sik1Q60670 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Sik1Q60670 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Sik1Q60670 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Sik1Q60670 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Sik1Q60670 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Sik1Q60670 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Sik1Q60670 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Sik1Q60670 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Sik1Q60670 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Sik1Q60670 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Sik1Q60670 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Sik1Q60670 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Sik1Q60670 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Sik1Q60670 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
Sik1Q60670 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Sik1Q60670 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Sik1Q60670 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Sik1Q60670 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Sik1Q60670 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Sik1Q60670 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Sik1Q60670 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Sik1Q60670 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Sik1Q60670 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Sik1Q60670 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Sik1Q60670 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20 ms