Protein–RNA interactions for Protein: Q60632

Nr2f1, COUP transcription factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 422 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nr2f1Q60632 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Nr2f1Q60632 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Nr2f1Q60632 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Nr2f1Q60632 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Nr2f1Q60632 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Nr2f1Q60632 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Nr2f1Q60632 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Nr2f1Q60632 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Nr2f1Q60632 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Nr2f1Q60632 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Nr2f1Q60632 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Nr2f1Q60632 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Nr2f1Q60632 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Nr2f1Q60632 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Nr2f1Q60632 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Nr2f1Q60632 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Nr2f1Q60632 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Nr2f1Q60632 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Nr2f1Q60632 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Nr2f1Q60632 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Nr2f1Q60632 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Nr2f1Q60632 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Nr2f1Q60632 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Nr2f1Q60632 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Nr2f1Q60632 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Nr2f1Q60632 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Nr2f1Q60632 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Nr2f1Q60632 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Nr2f1Q60632 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Nr2f1Q60632 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Nr2f1Q60632 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Nr2f1Q60632 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Nr2f1Q60632 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Nr2f1Q60632 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Nr2f1Q60632 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Nr2f1Q60632 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Nr2f1Q60632 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Nr2f1Q60632 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Nr2f1Q60632 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Nr2f1Q60632 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Nr2f1Q60632 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Nr2f1Q60632 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Nr2f1Q60632 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Nr2f1Q60632 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Nr2f1Q60632 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Nr2f1Q60632 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Nr2f1Q60632 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Nr2f1Q60632 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Nr2f1Q60632 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Nr2f1Q60632 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Nr2f1Q60632 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Nr2f1Q60632 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Nr2f1Q60632 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Nr2f1Q60632 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Nr2f1Q60632 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Nr2f1Q60632 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Nr2f1Q60632 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Nr2f1Q60632 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Nr2f1Q60632 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Nr2f1Q60632 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Nr2f1Q60632 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Nr2f1Q60632 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Nr2f1Q60632 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Nr2f1Q60632 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Nr2f1Q60632 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Nr2f1Q60632 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Nr2f1Q60632 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Nr2f1Q60632 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Nr2f1Q60632 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Nr2f1Q60632 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Nr2f1Q60632 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Nr2f1Q60632 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Nr2f1Q60632 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Nr2f1Q60632 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Nr2f1Q60632 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Nr2f1Q60632 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Nr2f1Q60632 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Nr2f1Q60632 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Nr2f1Q60632 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Nr2f1Q60632 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Nr2f1Q60632 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Nr2f1Q60632 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Nr2f1Q60632 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Nr2f1Q60632 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Nr2f1Q60632 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Nr2f1Q60632 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Nr2f1Q60632 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Nr2f1Q60632 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Nr2f1Q60632 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Nr2f1Q60632 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Nr2f1Q60632 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Nr2f1Q60632 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Nr2f1Q60632 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Nr2f1Q60632 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Nr2f1Q60632 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Nr2f1Q60632 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Nr2f1Q60632 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Nr2f1Q60632 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Nr2f1Q60632 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Nr2f1Q60632 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.2 ms