Protein–RNA interactions for Protein: Q60598

Cttn, Src substrate cortactin, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 546 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CttnQ60598 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
CttnQ60598 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.67
CttnQ60598 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
CttnQ60598 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
CttnQ60598 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
CttnQ60598 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
CttnQ60598 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
CttnQ60598 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
CttnQ60598 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
CttnQ60598 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
CttnQ60598 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
CttnQ60598 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
CttnQ60598 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
CttnQ60598 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
CttnQ60598 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC19.26■□□□□ 0.67
CttnQ60598 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
CttnQ60598 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
CttnQ60598 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
CttnQ60598 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
CttnQ60598 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
CttnQ60598 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
CttnQ60598 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
CttnQ60598 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
CttnQ60598 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
CttnQ60598 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
CttnQ60598 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
CttnQ60598 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
CttnQ60598 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
CttnQ60598 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
CttnQ60598 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
CttnQ60598 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC19.25■□□□□ 0.67
CttnQ60598 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
CttnQ60598 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC19.25■□□□□ 0.67
CttnQ60598 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
CttnQ60598 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
CttnQ60598 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC19.25■□□□□ 0.67
CttnQ60598 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
CttnQ60598 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
CttnQ60598 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
CttnQ60598 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
CttnQ60598 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
CttnQ60598 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
CttnQ60598 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
CttnQ60598 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
CttnQ60598 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
CttnQ60598 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
CttnQ60598 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
CttnQ60598 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
CttnQ60598 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
CttnQ60598 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
CttnQ60598 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
CttnQ60598 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
CttnQ60598 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
CttnQ60598 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
CttnQ60598 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
CttnQ60598 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
CttnQ60598 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
CttnQ60598 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
CttnQ60598 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC19.22■□□□□ 0.67
CttnQ60598 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
CttnQ60598 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
CttnQ60598 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
CttnQ60598 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
CttnQ60598 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
CttnQ60598 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
CttnQ60598 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
CttnQ60598 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
CttnQ60598 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
CttnQ60598 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
CttnQ60598 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
CttnQ60598 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
CttnQ60598 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
CttnQ60598 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
CttnQ60598 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC19.21■□□□□ 0.67
CttnQ60598 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC19.21■□□□□ 0.67
CttnQ60598 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
CttnQ60598 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC19.21■□□□□ 0.67
CttnQ60598 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
CttnQ60598 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
CttnQ60598 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC19.21■□□□□ 0.67
CttnQ60598 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
CttnQ60598 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.66
CttnQ60598 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CttnQ60598 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CttnQ60598 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CttnQ60598 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CttnQ60598 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CttnQ60598 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
CttnQ60598 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
CttnQ60598 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CttnQ60598 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
CttnQ60598 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
CttnQ60598 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CttnQ60598 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CttnQ60598 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
CttnQ60598 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC19.2■□□□□ 0.66
CttnQ60598 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CttnQ60598 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CttnQ60598 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CttnQ60598 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.3 ms