Protein–RNA interactions for Protein: Q5U901

Cpa6, Carboxypeptidase A6, mousemouse

Predictions only

Length 438 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cpa6Q5U901 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cpa6Q5U901 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cpa6Q5U901 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Cpa6Q5U901 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Cpa6Q5U901 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Cpa6Q5U901 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Cpa6Q5U901 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Cpa6Q5U901 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Cpa6Q5U901 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Cpa6Q5U901 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cpa6Q5U901 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cpa6Q5U901 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cpa6Q5U901 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cpa6Q5U901 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cpa6Q5U901 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cpa6Q5U901 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cpa6Q5U901 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cpa6Q5U901 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cpa6Q5U901 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cpa6Q5U901 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cpa6Q5U901 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cpa6Q5U901 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Cpa6Q5U901 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Cpa6Q5U901 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Cpa6Q5U901 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Cpa6Q5U901 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Cpa6Q5U901 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Cpa6Q5U901 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Cpa6Q5U901 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Cpa6Q5U901 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Cpa6Q5U901 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Cpa6Q5U901 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Cpa6Q5U901 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Cpa6Q5U901 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Cpa6Q5U901 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Cpa6Q5U901 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Cpa6Q5U901 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Cpa6Q5U901 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Cpa6Q5U901 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Cpa6Q5U901 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Cpa6Q5U901 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Cpa6Q5U901 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cpa6Q5U901 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cpa6Q5U901 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cpa6Q5U901 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cpa6Q5U901 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cpa6Q5U901 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cpa6Q5U901 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cpa6Q5U901 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cpa6Q5U901 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cpa6Q5U901 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cpa6Q5U901 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cpa6Q5U901 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cpa6Q5U901 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Cpa6Q5U901 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cpa6Q5U901 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cpa6Q5U901 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cpa6Q5U901 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cpa6Q5U901 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cpa6Q5U901 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cpa6Q5U901 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cpa6Q5U901 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cpa6Q5U901 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cpa6Q5U901 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cpa6Q5U901 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cpa6Q5U901 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cpa6Q5U901 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cpa6Q5U901 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cpa6Q5U901 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cpa6Q5U901 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cpa6Q5U901 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cpa6Q5U901 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cpa6Q5U901 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cpa6Q5U901 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cpa6Q5U901 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cpa6Q5U901 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cpa6Q5U901 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cpa6Q5U901 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Cpa6Q5U901 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Cpa6Q5U901 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Cpa6Q5U901 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Cpa6Q5U901 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Cpa6Q5U901 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Cpa6Q5U901 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Cpa6Q5U901 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Cpa6Q5U901 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Cpa6Q5U901 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Cpa6Q5U901 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Cpa6Q5U901 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Cpa6Q5U901 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Cpa6Q5U901 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Cpa6Q5U901 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Cpa6Q5U901 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Cpa6Q5U901 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Cpa6Q5U901 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Cpa6Q5U901 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Cpa6Q5U901 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Cpa6Q5U901 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Cpa6Q5U901 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Cpa6Q5U901 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.6 ms