Protein–RNA interactions for Protein: Q5U3K5

Rabl6, Rab-like protein 6, mousemouse

Predictions only

Length 725 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rabl6Q5U3K5 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rabl6Q5U3K5 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rabl6Q5U3K5 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rabl6Q5U3K5 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rabl6Q5U3K5 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rabl6Q5U3K5 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Rabl6Q5U3K5 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rabl6Q5U3K5 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rabl6Q5U3K5 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rabl6Q5U3K5 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rabl6Q5U3K5 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rabl6Q5U3K5 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rabl6Q5U3K5 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rabl6Q5U3K5 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rabl6Q5U3K5 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rabl6Q5U3K5 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rabl6Q5U3K5 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Rabl6Q5U3K5 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rabl6Q5U3K5 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rabl6Q5U3K5 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rabl6Q5U3K5 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rabl6Q5U3K5 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rabl6Q5U3K5 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rabl6Q5U3K5 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rabl6Q5U3K5 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Rabl6Q5U3K5 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Rabl6Q5U3K5 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Rabl6Q5U3K5 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Rabl6Q5U3K5 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Rabl6Q5U3K5 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Rabl6Q5U3K5 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Rabl6Q5U3K5 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Rabl6Q5U3K5 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Rabl6Q5U3K5 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Rabl6Q5U3K5 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Rabl6Q5U3K5 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Rabl6Q5U3K5 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Rabl6Q5U3K5 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Rabl6Q5U3K5 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Rabl6Q5U3K5 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Rabl6Q5U3K5 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Rabl6Q5U3K5 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Rabl6Q5U3K5 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rabl6Q5U3K5 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rabl6Q5U3K5 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rabl6Q5U3K5 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rabl6Q5U3K5 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rabl6Q5U3K5 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rabl6Q5U3K5 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rabl6Q5U3K5 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rabl6Q5U3K5 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rabl6Q5U3K5 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rabl6Q5U3K5 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rabl6Q5U3K5 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rabl6Q5U3K5 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rabl6Q5U3K5 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rabl6Q5U3K5 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rabl6Q5U3K5 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Rabl6Q5U3K5 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rabl6Q5U3K5 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rabl6Q5U3K5 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rabl6Q5U3K5 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC18■□□□□ 0.47
Rabl6Q5U3K5 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Rabl6Q5U3K5 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Rabl6Q5U3K5 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Rabl6Q5U3K5 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Rabl6Q5U3K5 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
Rabl6Q5U3K5 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Rabl6Q5U3K5 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Rabl6Q5U3K5 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Rabl6Q5U3K5 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Rabl6Q5U3K5 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Rabl6Q5U3K5 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Rabl6Q5U3K5 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rabl6Q5U3K5 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rabl6Q5U3K5 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rabl6Q5U3K5 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rabl6Q5U3K5 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rabl6Q5U3K5 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rabl6Q5U3K5 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Rabl6Q5U3K5 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rabl6Q5U3K5 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rabl6Q5U3K5 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rabl6Q5U3K5 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rabl6Q5U3K5 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rabl6Q5U3K5 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rabl6Q5U3K5 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rabl6Q5U3K5 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rabl6Q5U3K5 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rabl6Q5U3K5 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rabl6Q5U3K5 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rabl6Q5U3K5 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rabl6Q5U3K5 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rabl6Q5U3K5 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rabl6Q5U3K5 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rabl6Q5U3K5 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rabl6Q5U3K5 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Rabl6Q5U3K5 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rabl6Q5U3K5 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rabl6Q5U3K5 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.2 ms