Protein–RNA interactions for Protein: Q5TIS6

Noto, Homeobox protein notochord, mousemouse

Predictions only

Length 240 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NotoQ5TIS6 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
NotoQ5TIS6 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
NotoQ5TIS6 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
NotoQ5TIS6 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
NotoQ5TIS6 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
NotoQ5TIS6 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
NotoQ5TIS6 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
NotoQ5TIS6 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
NotoQ5TIS6 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
NotoQ5TIS6 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
NotoQ5TIS6 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
NotoQ5TIS6 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
NotoQ5TIS6 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
NotoQ5TIS6 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
NotoQ5TIS6 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
NotoQ5TIS6 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
NotoQ5TIS6 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
NotoQ5TIS6 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
NotoQ5TIS6 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
NotoQ5TIS6 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC15.08■□□□□ 0
NotoQ5TIS6 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
NotoQ5TIS6 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
NotoQ5TIS6 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
NotoQ5TIS6 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC15.08■□□□□ 0
NotoQ5TIS6 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
NotoQ5TIS6 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
NotoQ5TIS6 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
NotoQ5TIS6 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
NotoQ5TIS6 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
NotoQ5TIS6 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NotoQ5TIS6 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NotoQ5TIS6 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NotoQ5TIS6 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NotoQ5TIS6 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NotoQ5TIS6 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
NotoQ5TIS6 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
NotoQ5TIS6 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NotoQ5TIS6 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NotoQ5TIS6 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NotoQ5TIS6 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NotoQ5TIS6 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NotoQ5TIS6 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NotoQ5TIS6 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NotoQ5TIS6 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
NotoQ5TIS6 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NotoQ5TIS6 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NotoQ5TIS6 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC15.06■□□□□ 0
NotoQ5TIS6 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
NotoQ5TIS6 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NotoQ5TIS6 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NotoQ5TIS6 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NotoQ5TIS6 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NotoQ5TIS6 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
NotoQ5TIS6 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
NotoQ5TIS6 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NotoQ5TIS6 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NotoQ5TIS6 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NotoQ5TIS6 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NotoQ5TIS6 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NotoQ5TIS6 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
NotoQ5TIS6 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
NotoQ5TIS6 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
NotoQ5TIS6 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
NotoQ5TIS6 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
NotoQ5TIS6 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
NotoQ5TIS6 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
NotoQ5TIS6 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
NotoQ5TIS6 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
NotoQ5TIS6 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
NotoQ5TIS6 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC15.05■□□□□ -0
NotoQ5TIS6 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
NotoQ5TIS6 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
NotoQ5TIS6 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
NotoQ5TIS6 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
NotoQ5TIS6 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
NotoQ5TIS6 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
NotoQ5TIS6 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
NotoQ5TIS6 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
NotoQ5TIS6 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
NotoQ5TIS6 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
NotoQ5TIS6 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC15.04■□□□□ -0
NotoQ5TIS6 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
NotoQ5TIS6 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
NotoQ5TIS6 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
NotoQ5TIS6 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
NotoQ5TIS6 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
NotoQ5TIS6 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
NotoQ5TIS6 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
NotoQ5TIS6 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
NotoQ5TIS6 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
NotoQ5TIS6 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
NotoQ5TIS6 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
NotoQ5TIS6 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
NotoQ5TIS6 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
NotoQ5TIS6 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
NotoQ5TIS6 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
NotoQ5TIS6 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
NotoQ5TIS6 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
NotoQ5TIS6 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC15.03■□□□□ -0
NotoQ5TIS6 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.3 ms