Protein–RNA interactions for Protein: Q5SXY1

Specc1, Cytospin-B, mousemouse

Predictions only

Length 1,067 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Specc1Q5SXY1 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Specc1Q5SXY1 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Specc1Q5SXY1 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Specc1Q5SXY1 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
Specc1Q5SXY1 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Specc1Q5SXY1 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Specc1Q5SXY1 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
Specc1Q5SXY1 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Specc1Q5SXY1 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Specc1Q5SXY1 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Specc1Q5SXY1 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Specc1Q5SXY1 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Specc1Q5SXY1 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Specc1Q5SXY1 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Specc1Q5SXY1 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
Specc1Q5SXY1 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Specc1Q5SXY1 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
Specc1Q5SXY1 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Specc1Q5SXY1 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Specc1Q5SXY1 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Specc1Q5SXY1 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Specc1Q5SXY1 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Specc1Q5SXY1 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Specc1Q5SXY1 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Specc1Q5SXY1 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Specc1Q5SXY1 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Specc1Q5SXY1 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Specc1Q5SXY1 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Specc1Q5SXY1 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Specc1Q5SXY1 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Specc1Q5SXY1 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Specc1Q5SXY1 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Specc1Q5SXY1 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Specc1Q5SXY1 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Specc1Q5SXY1 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Specc1Q5SXY1 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Specc1Q5SXY1 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Specc1Q5SXY1 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Specc1Q5SXY1 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Specc1Q5SXY1 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Specc1Q5SXY1 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
Specc1Q5SXY1 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Specc1Q5SXY1 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Specc1Q5SXY1 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Specc1Q5SXY1 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Specc1Q5SXY1 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Specc1Q5SXY1 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Specc1Q5SXY1 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Specc1Q5SXY1 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Specc1Q5SXY1 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Specc1Q5SXY1 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Specc1Q5SXY1 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Specc1Q5SXY1 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Specc1Q5SXY1 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Specc1Q5SXY1 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Specc1Q5SXY1 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Specc1Q5SXY1 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Specc1Q5SXY1 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Specc1Q5SXY1 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Specc1Q5SXY1 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Specc1Q5SXY1 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Specc1Q5SXY1 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Specc1Q5SXY1 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Specc1Q5SXY1 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Specc1Q5SXY1 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Specc1Q5SXY1 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Specc1Q5SXY1 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
Specc1Q5SXY1 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Specc1Q5SXY1 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Specc1Q5SXY1 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Specc1Q5SXY1 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Specc1Q5SXY1 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Specc1Q5SXY1 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Specc1Q5SXY1 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Specc1Q5SXY1 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Specc1Q5SXY1 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Specc1Q5SXY1 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Specc1Q5SXY1 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Specc1Q5SXY1 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Specc1Q5SXY1 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Specc1Q5SXY1 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Specc1Q5SXY1 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Specc1Q5SXY1 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Specc1Q5SXY1 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Specc1Q5SXY1 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Specc1Q5SXY1 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Specc1Q5SXY1 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Specc1Q5SXY1 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
Specc1Q5SXY1 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Specc1Q5SXY1 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Specc1Q5SXY1 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Specc1Q5SXY1 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Specc1Q5SXY1 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Specc1Q5SXY1 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Specc1Q5SXY1 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Specc1Q5SXY1 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Specc1Q5SXY1 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Specc1Q5SXY1 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Specc1Q5SXY1 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Specc1Q5SXY1 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.7 ms