Protein–RNA interactions for Protein: Q5SXJ3

Brip1, Fanconi anemia group J protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,174 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Brip1Q5SXJ3 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Brip1Q5SXJ3 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Brip1Q5SXJ3 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Brip1Q5SXJ3 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Brip1Q5SXJ3 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Brip1Q5SXJ3 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Brip1Q5SXJ3 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Brip1Q5SXJ3 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Brip1Q5SXJ3 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Brip1Q5SXJ3 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Brip1Q5SXJ3 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Brip1Q5SXJ3 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Brip1Q5SXJ3 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Brip1Q5SXJ3 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Brip1Q5SXJ3 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Brip1Q5SXJ3 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Brip1Q5SXJ3 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
Brip1Q5SXJ3 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Brip1Q5SXJ3 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Brip1Q5SXJ3 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Brip1Q5SXJ3 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Brip1Q5SXJ3 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Brip1Q5SXJ3 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Brip1Q5SXJ3 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Brip1Q5SXJ3 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Brip1Q5SXJ3 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Brip1Q5SXJ3 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Brip1Q5SXJ3 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Brip1Q5SXJ3 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Brip1Q5SXJ3 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Brip1Q5SXJ3 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Brip1Q5SXJ3 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
Brip1Q5SXJ3 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Brip1Q5SXJ3 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
Brip1Q5SXJ3 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Brip1Q5SXJ3 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Brip1Q5SXJ3 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
Brip1Q5SXJ3 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
Brip1Q5SXJ3 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.95
Brip1Q5SXJ3 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Brip1Q5SXJ3 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Brip1Q5SXJ3 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Brip1Q5SXJ3 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Brip1Q5SXJ3 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Brip1Q5SXJ3 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Brip1Q5SXJ3 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Brip1Q5SXJ3 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
Brip1Q5SXJ3 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
Brip1Q5SXJ3 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Brip1Q5SXJ3 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Brip1Q5SXJ3 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Brip1Q5SXJ3 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
Brip1Q5SXJ3 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
Brip1Q5SXJ3 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Brip1Q5SXJ3 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Brip1Q5SXJ3 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Brip1Q5SXJ3 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21■□□□□ 0.95
Brip1Q5SXJ3 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
Brip1Q5SXJ3 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Brip1Q5SXJ3 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Brip1Q5SXJ3 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Brip1Q5SXJ3 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Brip1Q5SXJ3 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Brip1Q5SXJ3 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Brip1Q5SXJ3 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Brip1Q5SXJ3 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Brip1Q5SXJ3 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Brip1Q5SXJ3 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Brip1Q5SXJ3 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Brip1Q5SXJ3 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Brip1Q5SXJ3 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Brip1Q5SXJ3 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Brip1Q5SXJ3 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Brip1Q5SXJ3 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Brip1Q5SXJ3 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Brip1Q5SXJ3 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Brip1Q5SXJ3 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Brip1Q5SXJ3 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Brip1Q5SXJ3 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Brip1Q5SXJ3 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Brip1Q5SXJ3 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Brip1Q5SXJ3 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Brip1Q5SXJ3 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Brip1Q5SXJ3 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
Brip1Q5SXJ3 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Brip1Q5SXJ3 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Brip1Q5SXJ3 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
Brip1Q5SXJ3 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Brip1Q5SXJ3 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Brip1Q5SXJ3 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Brip1Q5SXJ3 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Brip1Q5SXJ3 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Brip1Q5SXJ3 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Brip1Q5SXJ3 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Brip1Q5SXJ3 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Brip1Q5SXJ3 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Brip1Q5SXJ3 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Brip1Q5SXJ3 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Brip1Q5SXJ3 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Brip1Q5SXJ3 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.2 ms