Protein–RNA interactions for Protein: Q5SWW4

Med13, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 13, mousemouse

Predictions only

Length 2,171 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Med13Q5SWW4 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Med13Q5SWW4 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Med13Q5SWW4 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Med13Q5SWW4 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Med13Q5SWW4 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Med13Q5SWW4 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Med13Q5SWW4 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Med13Q5SWW4 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Med13Q5SWW4 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Med13Q5SWW4 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Med13Q5SWW4 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Med13Q5SWW4 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Med13Q5SWW4 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Med13Q5SWW4 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Med13Q5SWW4 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Med13Q5SWW4 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Med13Q5SWW4 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Med13Q5SWW4 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Med13Q5SWW4 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Med13Q5SWW4 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Med13Q5SWW4 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Med13Q5SWW4 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Med13Q5SWW4 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Med13Q5SWW4 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Med13Q5SWW4 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Med13Q5SWW4 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Med13Q5SWW4 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Med13Q5SWW4 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Med13Q5SWW4 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Med13Q5SWW4 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Med13Q5SWW4 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Med13Q5SWW4 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Med13Q5SWW4 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Med13Q5SWW4 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Med13Q5SWW4 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Med13Q5SWW4 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Med13Q5SWW4 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Med13Q5SWW4 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Med13Q5SWW4 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Med13Q5SWW4 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Med13Q5SWW4 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Med13Q5SWW4 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Med13Q5SWW4 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Med13Q5SWW4 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Med13Q5SWW4 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Med13Q5SWW4 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Med13Q5SWW4 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Med13Q5SWW4 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Med13Q5SWW4 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Med13Q5SWW4 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Med13Q5SWW4 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Med13Q5SWW4 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Med13Q5SWW4 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Med13Q5SWW4 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Med13Q5SWW4 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Med13Q5SWW4 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Med13Q5SWW4 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Med13Q5SWW4 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Med13Q5SWW4 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Med13Q5SWW4 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Med13Q5SWW4 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Med13Q5SWW4 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Med13Q5SWW4 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Med13Q5SWW4 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Med13Q5SWW4 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Med13Q5SWW4 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Med13Q5SWW4 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Med13Q5SWW4 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Med13Q5SWW4 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Med13Q5SWW4 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Med13Q5SWW4 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Med13Q5SWW4 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Med13Q5SWW4 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Med13Q5SWW4 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Med13Q5SWW4 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Med13Q5SWW4 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Med13Q5SWW4 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Med13Q5SWW4 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Med13Q5SWW4 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Med13Q5SWW4 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Med13Q5SWW4 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Med13Q5SWW4 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Med13Q5SWW4 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Med13Q5SWW4 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Med13Q5SWW4 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Med13Q5SWW4 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Med13Q5SWW4 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Med13Q5SWW4 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Med13Q5SWW4 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Med13Q5SWW4 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Med13Q5SWW4 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Med13Q5SWW4 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Med13Q5SWW4 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Med13Q5SWW4 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Med13Q5SWW4 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Med13Q5SWW4 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Med13Q5SWW4 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Med13Q5SWW4 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Med13Q5SWW4 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Med13Q5SWW4 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.4 ms