Protein–RNA interactions for Protein: Q5SVD6

Vmn1r195, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

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Length 316 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r195Q5SVD6 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Vmn1r195Q5SVD6 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Vmn1r195Q5SVD6 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Vmn1r195Q5SVD6 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Vmn1r195Q5SVD6 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Vmn1r195Q5SVD6 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Vmn1r195Q5SVD6 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Vmn1r195Q5SVD6 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Vmn1r195Q5SVD6 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Vmn1r195Q5SVD6 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Vmn1r195Q5SVD6 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Vmn1r195Q5SVD6 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Vmn1r195Q5SVD6 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Vmn1r195Q5SVD6 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Vmn1r195Q5SVD6 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Vmn1r195Q5SVD6 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Vmn1r195Q5SVD6 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Vmn1r195Q5SVD6 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Vmn1r195Q5SVD6 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Vmn1r195Q5SVD6 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Vmn1r195Q5SVD6 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Vmn1r195Q5SVD6 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Vmn1r195Q5SVD6 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Vmn1r195Q5SVD6 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Vmn1r195Q5SVD6 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Vmn1r195Q5SVD6 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Vmn1r195Q5SVD6 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Vmn1r195Q5SVD6 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Vmn1r195Q5SVD6 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Vmn1r195Q5SVD6 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Vmn1r195Q5SVD6 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Vmn1r195Q5SVD6 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Vmn1r195Q5SVD6 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
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Vmn1r195Q5SVD6 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Vmn1r195Q5SVD6 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
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Vmn1r195Q5SVD6 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Vmn1r195Q5SVD6 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Vmn1r195Q5SVD6 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Vmn1r195Q5SVD6 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
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Vmn1r195Q5SVD6 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
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Vmn1r195Q5SVD6 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
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Vmn1r195Q5SVD6 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Vmn1r195Q5SVD6 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
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Vmn1r195Q5SVD6 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Vmn1r195Q5SVD6 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Vmn1r195Q5SVD6 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Vmn1r195Q5SVD6 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Vmn1r195Q5SVD6 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Vmn1r195Q5SVD6 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
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Vmn1r195Q5SVD6 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
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Vmn1r195Q5SVD6 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
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Vmn1r195Q5SVD6 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Vmn1r195Q5SVD6 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Vmn1r195Q5SVD6 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Vmn1r195Q5SVD6 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Vmn1r195Q5SVD6 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Vmn1r195Q5SVD6 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Vmn1r195Q5SVD6 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Vmn1r195Q5SVD6 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Vmn1r195Q5SVD6 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Vmn1r195Q5SVD6 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Vmn1r195Q5SVD6 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Vmn1r195Q5SVD6 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Vmn1r195Q5SVD6 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Vmn1r195Q5SVD6 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC14.48□□□□□ -0.09
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Vmn1r195Q5SVD6 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Vmn1r195Q5SVD6 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Vmn1r195Q5SVD6 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Vmn1r195Q5SVD6 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Vmn1r195Q5SVD6 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Vmn1r195Q5SVD6 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Vmn1r195Q5SVD6 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
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