Protein–RNA interactions for Protein: Q5SSI6

Utp18, U3 small nucleolar RNA-associated protein 18 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 552 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Utp18Q5SSI6 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Utp18Q5SSI6 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Utp18Q5SSI6 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Utp18Q5SSI6 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Utp18Q5SSI6 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Utp18Q5SSI6 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Utp18Q5SSI6 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Utp18Q5SSI6 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Utp18Q5SSI6 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Utp18Q5SSI6 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Utp18Q5SSI6 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
Utp18Q5SSI6 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Utp18Q5SSI6 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Utp18Q5SSI6 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Utp18Q5SSI6 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Utp18Q5SSI6 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Utp18Q5SSI6 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Utp18Q5SSI6 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Utp18Q5SSI6 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Utp18Q5SSI6 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Utp18Q5SSI6 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Utp18Q5SSI6 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Utp18Q5SSI6 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Utp18Q5SSI6 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Utp18Q5SSI6 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Utp18Q5SSI6 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Utp18Q5SSI6 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Utp18Q5SSI6 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Utp18Q5SSI6 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Utp18Q5SSI6 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
Utp18Q5SSI6 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Utp18Q5SSI6 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Utp18Q5SSI6 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Utp18Q5SSI6 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Utp18Q5SSI6 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
Utp18Q5SSI6 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
Utp18Q5SSI6 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
Utp18Q5SSI6 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
Utp18Q5SSI6 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Utp18Q5SSI6 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Utp18Q5SSI6 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Utp18Q5SSI6 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Utp18Q5SSI6 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Utp18Q5SSI6 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
Utp18Q5SSI6 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Utp18Q5SSI6 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Utp18Q5SSI6 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Utp18Q5SSI6 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
Utp18Q5SSI6 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Utp18Q5SSI6 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Utp18Q5SSI6 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Utp18Q5SSI6 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Utp18Q5SSI6 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Utp18Q5SSI6 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Utp18Q5SSI6 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Utp18Q5SSI6 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Utp18Q5SSI6 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Utp18Q5SSI6 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Utp18Q5SSI6 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Utp18Q5SSI6 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Utp18Q5SSI6 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Utp18Q5SSI6 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Utp18Q5SSI6 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Utp18Q5SSI6 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Utp18Q5SSI6 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Utp18Q5SSI6 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Utp18Q5SSI6 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Utp18Q5SSI6 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Utp18Q5SSI6 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Utp18Q5SSI6 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Utp18Q5SSI6 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Utp18Q5SSI6 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Utp18Q5SSI6 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Utp18Q5SSI6 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Utp18Q5SSI6 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Utp18Q5SSI6 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Utp18Q5SSI6 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Utp18Q5SSI6 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Utp18Q5SSI6 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Utp18Q5SSI6 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Utp18Q5SSI6 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Utp18Q5SSI6 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Utp18Q5SSI6 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Utp18Q5SSI6 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Utp18Q5SSI6 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Utp18Q5SSI6 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Utp18Q5SSI6 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Utp18Q5SSI6 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Utp18Q5SSI6 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Utp18Q5SSI6 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Utp18Q5SSI6 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Utp18Q5SSI6 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Utp18Q5SSI6 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Utp18Q5SSI6 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Utp18Q5SSI6 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Utp18Q5SSI6 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Utp18Q5SSI6 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Utp18Q5SSI6 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Utp18Q5SSI6 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Utp18Q5SSI6 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.3 ms