Protein–RNA interactions for Protein: Q5SPX3

Rnf215, RING finger protein 215, mousemouse

Predictions only

Length 379 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf215Q5SPX3 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Rnf215Q5SPX3 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Rnf215Q5SPX3 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Rnf215Q5SPX3 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Rnf215Q5SPX3 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Rnf215Q5SPX3 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Rnf215Q5SPX3 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Rnf215Q5SPX3 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Rnf215Q5SPX3 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Rnf215Q5SPX3 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Rnf215Q5SPX3 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Rnf215Q5SPX3 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Rnf215Q5SPX3 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Rnf215Q5SPX3 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Rnf215Q5SPX3 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Rnf215Q5SPX3 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Rnf215Q5SPX3 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Rnf215Q5SPX3 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Rnf215Q5SPX3 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Rnf215Q5SPX3 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Rnf215Q5SPX3 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Rnf215Q5SPX3 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Rnf215Q5SPX3 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Rnf215Q5SPX3 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Rnf215Q5SPX3 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Rnf215Q5SPX3 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Rnf215Q5SPX3 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Rnf215Q5SPX3 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Rnf215Q5SPX3 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Rnf215Q5SPX3 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Rnf215Q5SPX3 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Rnf215Q5SPX3 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Rnf215Q5SPX3 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Rnf215Q5SPX3 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Rnf215Q5SPX3 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Rnf215Q5SPX3 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Rnf215Q5SPX3 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Rnf215Q5SPX3 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Rnf215Q5SPX3 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Rnf215Q5SPX3 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Rnf215Q5SPX3 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Rnf215Q5SPX3 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Rnf215Q5SPX3 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Rnf215Q5SPX3 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Rnf215Q5SPX3 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Rnf215Q5SPX3 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Rnf215Q5SPX3 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Rnf215Q5SPX3 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Rnf215Q5SPX3 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Rnf215Q5SPX3 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Rnf215Q5SPX3 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Rnf215Q5SPX3 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rnf215Q5SPX3 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rnf215Q5SPX3 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rnf215Q5SPX3 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rnf215Q5SPX3 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rnf215Q5SPX3 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rnf215Q5SPX3 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Rnf215Q5SPX3 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rnf215Q5SPX3 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rnf215Q5SPX3 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rnf215Q5SPX3 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rnf215Q5SPX3 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rnf215Q5SPX3 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rnf215Q5SPX3 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rnf215Q5SPX3 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rnf215Q5SPX3 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rnf215Q5SPX3 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rnf215Q5SPX3 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rnf215Q5SPX3 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rnf215Q5SPX3 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rnf215Q5SPX3 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rnf215Q5SPX3 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rnf215Q5SPX3 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rnf215Q5SPX3 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Rnf215Q5SPX3 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rnf215Q5SPX3 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Rnf215Q5SPX3 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rnf215Q5SPX3 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rnf215Q5SPX3 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rnf215Q5SPX3 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rnf215Q5SPX3 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Rnf215Q5SPX3 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rnf215Q5SPX3 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rnf215Q5SPX3 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rnf215Q5SPX3 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rnf215Q5SPX3 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rnf215Q5SPX3 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rnf215Q5SPX3 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rnf215Q5SPX3 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rnf215Q5SPX3 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rnf215Q5SPX3 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rnf215Q5SPX3 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rnf215Q5SPX3 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rnf215Q5SPX3 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rnf215Q5SPX3 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rnf215Q5SPX3 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Rnf215Q5SPX3 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rnf215Q5SPX3 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rnf215Q5SPX3 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.3 ms