Protein–RNA interactions for Protein: Q5SPL2

Phf12, PHD finger protein 12, mousemouse

Predictions only

Length 1,003 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Phf12Q5SPL2 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Phf12Q5SPL2 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Phf12Q5SPL2 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Phf12Q5SPL2 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Phf12Q5SPL2 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Phf12Q5SPL2 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Phf12Q5SPL2 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Phf12Q5SPL2 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Phf12Q5SPL2 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Phf12Q5SPL2 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Phf12Q5SPL2 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Phf12Q5SPL2 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Phf12Q5SPL2 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Phf12Q5SPL2 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Phf12Q5SPL2 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Phf12Q5SPL2 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Phf12Q5SPL2 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Phf12Q5SPL2 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Phf12Q5SPL2 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Phf12Q5SPL2 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Phf12Q5SPL2 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Phf12Q5SPL2 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Phf12Q5SPL2 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Phf12Q5SPL2 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Phf12Q5SPL2 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Phf12Q5SPL2 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Phf12Q5SPL2 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Phf12Q5SPL2 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Phf12Q5SPL2 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Phf12Q5SPL2 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Phf12Q5SPL2 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Phf12Q5SPL2 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Phf12Q5SPL2 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Phf12Q5SPL2 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Phf12Q5SPL2 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Phf12Q5SPL2 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Phf12Q5SPL2 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Phf12Q5SPL2 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Phf12Q5SPL2 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Phf12Q5SPL2 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Phf12Q5SPL2 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Phf12Q5SPL2 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Phf12Q5SPL2 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Phf12Q5SPL2 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Phf12Q5SPL2 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Phf12Q5SPL2 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Phf12Q5SPL2 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Phf12Q5SPL2 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Phf12Q5SPL2 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Phf12Q5SPL2 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Phf12Q5SPL2 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Phf12Q5SPL2 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Phf12Q5SPL2 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Phf12Q5SPL2 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Phf12Q5SPL2 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Phf12Q5SPL2 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Phf12Q5SPL2 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Phf12Q5SPL2 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Phf12Q5SPL2 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Phf12Q5SPL2 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Phf12Q5SPL2 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Phf12Q5SPL2 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Phf12Q5SPL2 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Phf12Q5SPL2 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Phf12Q5SPL2 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Phf12Q5SPL2 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Phf12Q5SPL2 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Phf12Q5SPL2 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Phf12Q5SPL2 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Phf12Q5SPL2 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Phf12Q5SPL2 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Phf12Q5SPL2 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Phf12Q5SPL2 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Phf12Q5SPL2 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Phf12Q5SPL2 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Phf12Q5SPL2 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Phf12Q5SPL2 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Phf12Q5SPL2 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Phf12Q5SPL2 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Phf12Q5SPL2 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Phf12Q5SPL2 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Phf12Q5SPL2 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Phf12Q5SPL2 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Phf12Q5SPL2 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Phf12Q5SPL2 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Phf12Q5SPL2 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Phf12Q5SPL2 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Phf12Q5SPL2 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Phf12Q5SPL2 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Phf12Q5SPL2 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Phf12Q5SPL2 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Phf12Q5SPL2 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Phf12Q5SPL2 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Phf12Q5SPL2 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Phf12Q5SPL2 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Phf12Q5SPL2 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Phf12Q5SPL2 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Phf12Q5SPL2 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Phf12Q5SPL2 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Phf12Q5SPL2 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.3 ms