Protein–RNA interactions for Protein: Q5SNZ0

Ccdc88a, Girdin, mousemouse

Predictions only

Length 1,873 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc88aQ5SNZ0 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ccdc88aQ5SNZ0 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ccdc88aQ5SNZ0 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
Ccdc88aQ5SNZ0 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ccdc88aQ5SNZ0 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ccdc88aQ5SNZ0 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ccdc88aQ5SNZ0 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
Ccdc88aQ5SNZ0 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
Ccdc88aQ5SNZ0 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ccdc88aQ5SNZ0 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ccdc88aQ5SNZ0 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ccdc88aQ5SNZ0 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ccdc88aQ5SNZ0 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ccdc88aQ5SNZ0 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ccdc88aQ5SNZ0 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ccdc88aQ5SNZ0 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ccdc88aQ5SNZ0 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ccdc88aQ5SNZ0 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ccdc88aQ5SNZ0 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ccdc88aQ5SNZ0 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ccdc88aQ5SNZ0 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
Ccdc88aQ5SNZ0 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ccdc88aQ5SNZ0 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
Ccdc88aQ5SNZ0 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
Ccdc88aQ5SNZ0 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ccdc88aQ5SNZ0 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ccdc88aQ5SNZ0 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ccdc88aQ5SNZ0 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ccdc88aQ5SNZ0 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ccdc88aQ5SNZ0 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ccdc88aQ5SNZ0 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
Ccdc88aQ5SNZ0 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
Ccdc88aQ5SNZ0 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ccdc88aQ5SNZ0 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ccdc88aQ5SNZ0 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
Ccdc88aQ5SNZ0 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ccdc88aQ5SNZ0 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ccdc88aQ5SNZ0 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ccdc88aQ5SNZ0 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ccdc88aQ5SNZ0 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ccdc88aQ5SNZ0 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ccdc88aQ5SNZ0 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ccdc88aQ5SNZ0 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
Ccdc88aQ5SNZ0 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ccdc88aQ5SNZ0 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ccdc88aQ5SNZ0 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ccdc88aQ5SNZ0 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ccdc88aQ5SNZ0 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ccdc88aQ5SNZ0 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ccdc88aQ5SNZ0 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ccdc88aQ5SNZ0 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
Ccdc88aQ5SNZ0 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ccdc88aQ5SNZ0 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ccdc88aQ5SNZ0 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
Ccdc88aQ5SNZ0 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ccdc88aQ5SNZ0 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ccdc88aQ5SNZ0 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ccdc88aQ5SNZ0 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ccdc88aQ5SNZ0 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ccdc88aQ5SNZ0 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ccdc88aQ5SNZ0 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ccdc88aQ5SNZ0 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ccdc88aQ5SNZ0 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ccdc88aQ5SNZ0 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ccdc88aQ5SNZ0 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ccdc88aQ5SNZ0 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ccdc88aQ5SNZ0 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ccdc88aQ5SNZ0 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ccdc88aQ5SNZ0 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ccdc88aQ5SNZ0 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
Ccdc88aQ5SNZ0 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ccdc88aQ5SNZ0 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ccdc88aQ5SNZ0 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ccdc88aQ5SNZ0 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ccdc88aQ5SNZ0 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ccdc88aQ5SNZ0 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ccdc88aQ5SNZ0 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ccdc88aQ5SNZ0 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ccdc88aQ5SNZ0 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ccdc88aQ5SNZ0 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ccdc88aQ5SNZ0 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ccdc88aQ5SNZ0 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ccdc88aQ5SNZ0 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ccdc88aQ5SNZ0 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ccdc88aQ5SNZ0 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
Ccdc88aQ5SNZ0 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Ccdc88aQ5SNZ0 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Ccdc88aQ5SNZ0 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Ccdc88aQ5SNZ0 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Ccdc88aQ5SNZ0 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
Ccdc88aQ5SNZ0 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Ccdc88aQ5SNZ0 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
Ccdc88aQ5SNZ0 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
Ccdc88aQ5SNZ0 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Ccdc88aQ5SNZ0 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Ccdc88aQ5SNZ0 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Ccdc88aQ5SNZ0 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Ccdc88aQ5SNZ0 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Ccdc88aQ5SNZ0 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ccdc88aQ5SNZ0 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22 ms