Protein–RNA interactions for Protein: Q5NCJ1

Rapgef6, Rap guanine nucleotide exchange factor (GEF) 6, mousemouse

Predictions only

Length 1,609 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rapgef6Q5NCJ1 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC27.79■■■□□ 2.04
Rapgef6Q5NCJ1 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
Rapgef6Q5NCJ1 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Rapgef6Q5NCJ1 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Rapgef6Q5NCJ1 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Rapgef6Q5NCJ1 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Rapgef6Q5NCJ1 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Rapgef6Q5NCJ1 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Rapgef6Q5NCJ1 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Rapgef6Q5NCJ1 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Rapgef6Q5NCJ1 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
Rapgef6Q5NCJ1 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
Rapgef6Q5NCJ1 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Rapgef6Q5NCJ1 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Rapgef6Q5NCJ1 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Rapgef6Q5NCJ1 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Rapgef6Q5NCJ1 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Rapgef6Q5NCJ1 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Rapgef6Q5NCJ1 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Rapgef6Q5NCJ1 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC27.77■■■□□ 2.04
Rapgef6Q5NCJ1 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC27.77■■■□□ 2.04
Rapgef6Q5NCJ1 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Rapgef6Q5NCJ1 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Rapgef6Q5NCJ1 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.04
Rapgef6Q5NCJ1 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Rapgef6Q5NCJ1 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Rapgef6Q5NCJ1 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Rapgef6Q5NCJ1 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Rapgef6Q5NCJ1 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Rapgef6Q5NCJ1 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC27.76■■■□□ 2.03
Rapgef6Q5NCJ1 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Rapgef6Q5NCJ1 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Rapgef6Q5NCJ1 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Rapgef6Q5NCJ1 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Rapgef6Q5NCJ1 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC27.76■■■□□ 2.03
Rapgef6Q5NCJ1 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Rapgef6Q5NCJ1 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Rapgef6Q5NCJ1 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Rapgef6Q5NCJ1 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Rapgef6Q5NCJ1 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Rapgef6Q5NCJ1 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Rapgef6Q5NCJ1 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Rapgef6Q5NCJ1 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Rapgef6Q5NCJ1 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
Rapgef6Q5NCJ1 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
Rapgef6Q5NCJ1 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Rapgef6Q5NCJ1 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Rapgef6Q5NCJ1 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Rapgef6Q5NCJ1 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC27.74■■■□□ 2.03
Rapgef6Q5NCJ1 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
Rapgef6Q5NCJ1 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC27.74■■■□□ 2.03
Rapgef6Q5NCJ1 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Rapgef6Q5NCJ1 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
Rapgef6Q5NCJ1 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
Rapgef6Q5NCJ1 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Rapgef6Q5NCJ1 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Rapgef6Q5NCJ1 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
Rapgef6Q5NCJ1 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
Rapgef6Q5NCJ1 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
Rapgef6Q5NCJ1 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
Rapgef6Q5NCJ1 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.73■■■□□ 2.03
Rapgef6Q5NCJ1 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Rapgef6Q5NCJ1 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
Rapgef6Q5NCJ1 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Rapgef6Q5NCJ1 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Rapgef6Q5NCJ1 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Rapgef6Q5NCJ1 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
Rapgef6Q5NCJ1 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Rapgef6Q5NCJ1 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Rapgef6Q5NCJ1 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Rapgef6Q5NCJ1 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Rapgef6Q5NCJ1 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Rapgef6Q5NCJ1 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC27.71■■■□□ 2.03
Rapgef6Q5NCJ1 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Rapgef6Q5NCJ1 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Rapgef6Q5NCJ1 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Rapgef6Q5NCJ1 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
Rapgef6Q5NCJ1 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Rapgef6Q5NCJ1 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Rapgef6Q5NCJ1 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC27.7■■■□□ 2.03
Rapgef6Q5NCJ1 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.03
Rapgef6Q5NCJ1 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC27.7■■■□□ 2.03
Rapgef6Q5NCJ1 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
Rapgef6Q5NCJ1 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC27.7■■■□□ 2.02
Rapgef6Q5NCJ1 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC27.7■■■□□ 2.02
Rapgef6Q5NCJ1 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Rapgef6Q5NCJ1 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Rapgef6Q5NCJ1 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
Rapgef6Q5NCJ1 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Rapgef6Q5NCJ1 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
Rapgef6Q5NCJ1 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
Rapgef6Q5NCJ1 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
Rapgef6Q5NCJ1 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
Rapgef6Q5NCJ1 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Rapgef6Q5NCJ1 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Rapgef6Q5NCJ1 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Rapgef6Q5NCJ1 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Rapgef6Q5NCJ1 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
Rapgef6Q5NCJ1 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Rapgef6Q5NCJ1 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.3 ms