Protein–RNA interactions for Protein: Q5NCC9

Trim58, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM58, mousemouse

Predictions only

Length 485 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim58Q5NCC9 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Trim58Q5NCC9 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Trim58Q5NCC9 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Trim58Q5NCC9 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Trim58Q5NCC9 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Trim58Q5NCC9 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Trim58Q5NCC9 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Trim58Q5NCC9 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Trim58Q5NCC9 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Trim58Q5NCC9 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Trim58Q5NCC9 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Trim58Q5NCC9 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Trim58Q5NCC9 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Trim58Q5NCC9 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Trim58Q5NCC9 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Trim58Q5NCC9 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Trim58Q5NCC9 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Trim58Q5NCC9 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Trim58Q5NCC9 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Trim58Q5NCC9 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Trim58Q5NCC9 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
Trim58Q5NCC9 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Trim58Q5NCC9 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Trim58Q5NCC9 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Trim58Q5NCC9 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Trim58Q5NCC9 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Trim58Q5NCC9 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Trim58Q5NCC9 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Trim58Q5NCC9 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Trim58Q5NCC9 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
Trim58Q5NCC9 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Trim58Q5NCC9 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Trim58Q5NCC9 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Trim58Q5NCC9 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Trim58Q5NCC9 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Trim58Q5NCC9 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Trim58Q5NCC9 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Trim58Q5NCC9 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Trim58Q5NCC9 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Trim58Q5NCC9 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Trim58Q5NCC9 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Trim58Q5NCC9 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Trim58Q5NCC9 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
Trim58Q5NCC9 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Trim58Q5NCC9 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
Trim58Q5NCC9 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Trim58Q5NCC9 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Trim58Q5NCC9 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Trim58Q5NCC9 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Trim58Q5NCC9 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Trim58Q5NCC9 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Trim58Q5NCC9 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Trim58Q5NCC9 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Trim58Q5NCC9 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Trim58Q5NCC9 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Trim58Q5NCC9 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Trim58Q5NCC9 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Trim58Q5NCC9 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Trim58Q5NCC9 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Trim58Q5NCC9 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Trim58Q5NCC9 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Trim58Q5NCC9 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Trim58Q5NCC9 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Trim58Q5NCC9 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Trim58Q5NCC9 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Trim58Q5NCC9 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Trim58Q5NCC9 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Trim58Q5NCC9 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Trim58Q5NCC9 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Trim58Q5NCC9 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Trim58Q5NCC9 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Trim58Q5NCC9 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Trim58Q5NCC9 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Trim58Q5NCC9 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Trim58Q5NCC9 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Trim58Q5NCC9 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Trim58Q5NCC9 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Trim58Q5NCC9 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Trim58Q5NCC9 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Trim58Q5NCC9 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Trim58Q5NCC9 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Trim58Q5NCC9 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Trim58Q5NCC9 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Trim58Q5NCC9 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Trim58Q5NCC9 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Trim58Q5NCC9 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
Trim58Q5NCC9 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
Trim58Q5NCC9 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Trim58Q5NCC9 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Trim58Q5NCC9 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Trim58Q5NCC9 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Trim58Q5NCC9 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Trim58Q5NCC9 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Trim58Q5NCC9 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Trim58Q5NCC9 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Trim58Q5NCC9 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Trim58Q5NCC9 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Trim58Q5NCC9 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Trim58Q5NCC9 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Trim58Q5NCC9 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.7 ms