Protein–RNA interactions for Protein: Q5NC05

Ttf2, Transcription termination factor 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,138 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttf2Q5NC05 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Ttf2Q5NC05 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Ttf2Q5NC05 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Ttf2Q5NC05 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Ttf2Q5NC05 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
Ttf2Q5NC05 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Ttf2Q5NC05 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Ttf2Q5NC05 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Ttf2Q5NC05 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Ttf2Q5NC05 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Ttf2Q5NC05 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Ttf2Q5NC05 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Ttf2Q5NC05 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Ttf2Q5NC05 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Ttf2Q5NC05 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Ttf2Q5NC05 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Ttf2Q5NC05 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Ttf2Q5NC05 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Ttf2Q5NC05 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Ttf2Q5NC05 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Ttf2Q5NC05 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Ttf2Q5NC05 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Ttf2Q5NC05 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Ttf2Q5NC05 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Ttf2Q5NC05 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Ttf2Q5NC05 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Ttf2Q5NC05 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Ttf2Q5NC05 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Ttf2Q5NC05 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Ttf2Q5NC05 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Ttf2Q5NC05 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Ttf2Q5NC05 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Ttf2Q5NC05 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Ttf2Q5NC05 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
Ttf2Q5NC05 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
Ttf2Q5NC05 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Ttf2Q5NC05 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Ttf2Q5NC05 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Ttf2Q5NC05 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Ttf2Q5NC05 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Ttf2Q5NC05 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC19.52■□□□□ 0.71
Ttf2Q5NC05 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Ttf2Q5NC05 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC19.52■□□□□ 0.71
Ttf2Q5NC05 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Ttf2Q5NC05 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Ttf2Q5NC05 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Ttf2Q5NC05 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Ttf2Q5NC05 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Ttf2Q5NC05 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Ttf2Q5NC05 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Ttf2Q5NC05 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Ttf2Q5NC05 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Ttf2Q5NC05 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Ttf2Q5NC05 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Ttf2Q5NC05 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Ttf2Q5NC05 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
Ttf2Q5NC05 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Ttf2Q5NC05 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Ttf2Q5NC05 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Ttf2Q5NC05 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
Ttf2Q5NC05 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Ttf2Q5NC05 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Ttf2Q5NC05 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Ttf2Q5NC05 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Ttf2Q5NC05 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Ttf2Q5NC05 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Ttf2Q5NC05 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Ttf2Q5NC05 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Ttf2Q5NC05 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Ttf2Q5NC05 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Ttf2Q5NC05 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Ttf2Q5NC05 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Ttf2Q5NC05 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Ttf2Q5NC05 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Ttf2Q5NC05 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Ttf2Q5NC05 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Ttf2Q5NC05 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Ttf2Q5NC05 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Ttf2Q5NC05 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
Ttf2Q5NC05 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Ttf2Q5NC05 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Ttf2Q5NC05 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Ttf2Q5NC05 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Ttf2Q5NC05 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Ttf2Q5NC05 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Ttf2Q5NC05 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Ttf2Q5NC05 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Ttf2Q5NC05 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Ttf2Q5NC05 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Ttf2Q5NC05 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Ttf2Q5NC05 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Ttf2Q5NC05 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Ttf2Q5NC05 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Ttf2Q5NC05 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Ttf2Q5NC05 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Ttf2Q5NC05 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Ttf2Q5NC05 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Ttf2Q5NC05 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Ttf2Q5NC05 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Ttf2Q5NC05 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.4 ms