Protein–RNA interactions for Protein: Q5NBX1

Cobl, Protein cordon-bleu, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,337 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CoblQ5NBX1 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CoblQ5NBX1 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CoblQ5NBX1 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CoblQ5NBX1 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
CoblQ5NBX1 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CoblQ5NBX1 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CoblQ5NBX1 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CoblQ5NBX1 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CoblQ5NBX1 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CoblQ5NBX1 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CoblQ5NBX1 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CoblQ5NBX1 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
CoblQ5NBX1 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
CoblQ5NBX1 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CoblQ5NBX1 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CoblQ5NBX1 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CoblQ5NBX1 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CoblQ5NBX1 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CoblQ5NBX1 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CoblQ5NBX1 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CoblQ5NBX1 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CoblQ5NBX1 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CoblQ5NBX1 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
CoblQ5NBX1 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CoblQ5NBX1 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CoblQ5NBX1 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CoblQ5NBX1 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CoblQ5NBX1 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CoblQ5NBX1 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CoblQ5NBX1 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CoblQ5NBX1 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CoblQ5NBX1 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
CoblQ5NBX1 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CoblQ5NBX1 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CoblQ5NBX1 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CoblQ5NBX1 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CoblQ5NBX1 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CoblQ5NBX1 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CoblQ5NBX1 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CoblQ5NBX1 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CoblQ5NBX1 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CoblQ5NBX1 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CoblQ5NBX1 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CoblQ5NBX1 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CoblQ5NBX1 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CoblQ5NBX1 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CoblQ5NBX1 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CoblQ5NBX1 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CoblQ5NBX1 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CoblQ5NBX1 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CoblQ5NBX1 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CoblQ5NBX1 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CoblQ5NBX1 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
CoblQ5NBX1 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC22.89■■□□□ 1.26
CoblQ5NBX1 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
CoblQ5NBX1 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
CoblQ5NBX1 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC22.89■■□□□ 1.26
CoblQ5NBX1 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.26
CoblQ5NBX1 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CoblQ5NBX1 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CoblQ5NBX1 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CoblQ5NBX1 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CoblQ5NBX1 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CoblQ5NBX1 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CoblQ5NBX1 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
CoblQ5NBX1 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CoblQ5NBX1 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CoblQ5NBX1 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CoblQ5NBX1 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CoblQ5NBX1 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CoblQ5NBX1 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CoblQ5NBX1 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CoblQ5NBX1 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CoblQ5NBX1 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CoblQ5NBX1 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CoblQ5NBX1 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CoblQ5NBX1 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CoblQ5NBX1 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CoblQ5NBX1 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CoblQ5NBX1 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CoblQ5NBX1 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CoblQ5NBX1 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CoblQ5NBX1 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CoblQ5NBX1 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CoblQ5NBX1 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CoblQ5NBX1 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CoblQ5NBX1 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CoblQ5NBX1 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CoblQ5NBX1 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CoblQ5NBX1 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CoblQ5NBX1 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CoblQ5NBX1 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CoblQ5NBX1 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CoblQ5NBX1 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CoblQ5NBX1 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CoblQ5NBX1 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CoblQ5NBX1 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CoblQ5NBX1 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CoblQ5NBX1 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CoblQ5NBX1 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18 ms