Protein–RNA interactions for Protein: Q5G5D5

Syna, Syncytin-A, mousemouse

Predictions only

Length 617 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SynaQ5G5D5 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
SynaQ5G5D5 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
SynaQ5G5D5 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
SynaQ5G5D5 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
SynaQ5G5D5 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
SynaQ5G5D5 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
SynaQ5G5D5 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
SynaQ5G5D5 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
SynaQ5G5D5 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
SynaQ5G5D5 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
SynaQ5G5D5 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
SynaQ5G5D5 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
SynaQ5G5D5 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
SynaQ5G5D5 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
SynaQ5G5D5 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
SynaQ5G5D5 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
SynaQ5G5D5 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
SynaQ5G5D5 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
SynaQ5G5D5 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
SynaQ5G5D5 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
SynaQ5G5D5 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
SynaQ5G5D5 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
SynaQ5G5D5 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
SynaQ5G5D5 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SynaQ5G5D5 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SynaQ5G5D5 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SynaQ5G5D5 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SynaQ5G5D5 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
SynaQ5G5D5 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
SynaQ5G5D5 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC18.76■□□□□ 0.59
SynaQ5G5D5 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
SynaQ5G5D5 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SynaQ5G5D5 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SynaQ5G5D5 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SynaQ5G5D5 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SynaQ5G5D5 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SynaQ5G5D5 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SynaQ5G5D5 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SynaQ5G5D5 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SynaQ5G5D5 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SynaQ5G5D5 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
SynaQ5G5D5 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
SynaQ5G5D5 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SynaQ5G5D5 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SynaQ5G5D5 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SynaQ5G5D5 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SynaQ5G5D5 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SynaQ5G5D5 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SynaQ5G5D5 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SynaQ5G5D5 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SynaQ5G5D5 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SynaQ5G5D5 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SynaQ5G5D5 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SynaQ5G5D5 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SynaQ5G5D5 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SynaQ5G5D5 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SynaQ5G5D5 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SynaQ5G5D5 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SynaQ5G5D5 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SynaQ5G5D5 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SynaQ5G5D5 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SynaQ5G5D5 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SynaQ5G5D5 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
SynaQ5G5D5 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SynaQ5G5D5 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
SynaQ5G5D5 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SynaQ5G5D5 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SynaQ5G5D5 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SynaQ5G5D5 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SynaQ5G5D5 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SynaQ5G5D5 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SynaQ5G5D5 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SynaQ5G5D5 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SynaQ5G5D5 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
SynaQ5G5D5 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SynaQ5G5D5 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SynaQ5G5D5 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SynaQ5G5D5 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SynaQ5G5D5 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
SynaQ5G5D5 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SynaQ5G5D5 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SynaQ5G5D5 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SynaQ5G5D5 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SynaQ5G5D5 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SynaQ5G5D5 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SynaQ5G5D5 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SynaQ5G5D5 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SynaQ5G5D5 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
SynaQ5G5D5 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SynaQ5G5D5 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SynaQ5G5D5 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
SynaQ5G5D5 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SynaQ5G5D5 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
SynaQ5G5D5 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SynaQ5G5D5 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.58
SynaQ5G5D5 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.58
SynaQ5G5D5 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SynaQ5G5D5 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SynaQ5G5D5 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
SynaQ5G5D5 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.9 ms