Protein–RNA interactions for Protein: Q5EG47

Prkaa1, 5'-AMP-activated protein kinase catalytic subunit alpha-1, mousemouse

Predictions only

Length 559 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prkaa1Q5EG47 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Prkaa1Q5EG47 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
Prkaa1Q5EG47 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Prkaa1Q5EG47 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Prkaa1Q5EG47 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Prkaa1Q5EG47 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Prkaa1Q5EG47 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Prkaa1Q5EG47 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Prkaa1Q5EG47 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Prkaa1Q5EG47 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
Prkaa1Q5EG47 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Prkaa1Q5EG47 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Prkaa1Q5EG47 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Prkaa1Q5EG47 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Prkaa1Q5EG47 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Prkaa1Q5EG47 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Prkaa1Q5EG47 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Prkaa1Q5EG47 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Prkaa1Q5EG47 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Prkaa1Q5EG47 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Prkaa1Q5EG47 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Prkaa1Q5EG47 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
Prkaa1Q5EG47 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Prkaa1Q5EG47 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Prkaa1Q5EG47 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Prkaa1Q5EG47 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Prkaa1Q5EG47 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Prkaa1Q5EG47 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Prkaa1Q5EG47 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Prkaa1Q5EG47 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Prkaa1Q5EG47 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Prkaa1Q5EG47 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Prkaa1Q5EG47 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Prkaa1Q5EG47 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Prkaa1Q5EG47 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Prkaa1Q5EG47 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Prkaa1Q5EG47 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Prkaa1Q5EG47 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Prkaa1Q5EG47 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Prkaa1Q5EG47 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Prkaa1Q5EG47 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
Prkaa1Q5EG47 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Prkaa1Q5EG47 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Prkaa1Q5EG47 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Prkaa1Q5EG47 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Prkaa1Q5EG47 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Prkaa1Q5EG47 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Prkaa1Q5EG47 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Prkaa1Q5EG47 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Prkaa1Q5EG47 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Prkaa1Q5EG47 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Prkaa1Q5EG47 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Prkaa1Q5EG47 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Prkaa1Q5EG47 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Prkaa1Q5EG47 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
Prkaa1Q5EG47 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Prkaa1Q5EG47 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Prkaa1Q5EG47 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Prkaa1Q5EG47 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Prkaa1Q5EG47 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
Prkaa1Q5EG47 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Prkaa1Q5EG47 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Prkaa1Q5EG47 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Prkaa1Q5EG47 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Prkaa1Q5EG47 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Prkaa1Q5EG47 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
Prkaa1Q5EG47 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Prkaa1Q5EG47 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Prkaa1Q5EG47 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Prkaa1Q5EG47 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Prkaa1Q5EG47 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Prkaa1Q5EG47 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Prkaa1Q5EG47 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Prkaa1Q5EG47 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Prkaa1Q5EG47 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Prkaa1Q5EG47 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Prkaa1Q5EG47 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Prkaa1Q5EG47 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Prkaa1Q5EG47 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Prkaa1Q5EG47 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Prkaa1Q5EG47 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Prkaa1Q5EG47 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Prkaa1Q5EG47 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Prkaa1Q5EG47 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Prkaa1Q5EG47 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Prkaa1Q5EG47 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Prkaa1Q5EG47 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Prkaa1Q5EG47 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Prkaa1Q5EG47 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Prkaa1Q5EG47 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Prkaa1Q5EG47 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Prkaa1Q5EG47 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Prkaa1Q5EG47 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Prkaa1Q5EG47 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Prkaa1Q5EG47 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Prkaa1Q5EG47 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Prkaa1Q5EG47 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Prkaa1Q5EG47 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
Prkaa1Q5EG47 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Prkaa1Q5EG47 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.2 ms