Protein–RNA interactions for Protein: Q59J78

Ndufaf2, NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 alpha subcomplex assembly factor 2, mousemouse

Predictions only

Length 168 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ndufaf2Q59J78 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Ndufaf2Q59J78 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Ndufaf2Q59J78 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Ndufaf2Q59J78 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Ndufaf2Q59J78 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
Ndufaf2Q59J78 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC19■□□□□ 0.63
Ndufaf2Q59J78 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Ndufaf2Q59J78 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Ndufaf2Q59J78 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC19■□□□□ 0.63
Ndufaf2Q59J78 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Ndufaf2Q59J78 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Ndufaf2Q59J78 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC19■□□□□ 0.63
Ndufaf2Q59J78 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Ndufaf2Q59J78 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Ndufaf2Q59J78 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ndufaf2Q59J78 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ndufaf2Q59J78 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ndufaf2Q59J78 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ndufaf2Q59J78 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ndufaf2Q59J78 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ndufaf2Q59J78 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
Ndufaf2Q59J78 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ndufaf2Q59J78 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ndufaf2Q59J78 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ndufaf2Q59J78 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ndufaf2Q59J78 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ndufaf2Q59J78 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ndufaf2Q59J78 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ndufaf2Q59J78 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ndufaf2Q59J78 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ndufaf2Q59J78 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ndufaf2Q59J78 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ndufaf2Q59J78 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ndufaf2Q59J78 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ndufaf2Q59J78 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ndufaf2Q59J78 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ndufaf2Q59J78 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ndufaf2Q59J78 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ndufaf2Q59J78 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
Ndufaf2Q59J78 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ndufaf2Q59J78 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ndufaf2Q59J78 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ndufaf2Q59J78 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ndufaf2Q59J78 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ndufaf2Q59J78 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ndufaf2Q59J78 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ndufaf2Q59J78 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ndufaf2Q59J78 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ndufaf2Q59J78 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ndufaf2Q59J78 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ndufaf2Q59J78 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ndufaf2Q59J78 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ndufaf2Q59J78 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ndufaf2Q59J78 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ndufaf2Q59J78 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ndufaf2Q59J78 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ndufaf2Q59J78 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ndufaf2Q59J78 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ndufaf2Q59J78 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ndufaf2Q59J78 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ndufaf2Q59J78 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ndufaf2Q59J78 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ndufaf2Q59J78 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ndufaf2Q59J78 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ndufaf2Q59J78 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ndufaf2Q59J78 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ndufaf2Q59J78 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ndufaf2Q59J78 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ndufaf2Q59J78 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ndufaf2Q59J78 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ndufaf2Q59J78 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
Ndufaf2Q59J78 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ndufaf2Q59J78 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ndufaf2Q59J78 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ndufaf2Q59J78 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ndufaf2Q59J78 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ndufaf2Q59J78 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ndufaf2Q59J78 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ndufaf2Q59J78 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ndufaf2Q59J78 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ndufaf2Q59J78 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
Ndufaf2Q59J78 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
Ndufaf2Q59J78 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ndufaf2Q59J78 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ndufaf2Q59J78 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ndufaf2Q59J78 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ndufaf2Q59J78 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ndufaf2Q59J78 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ndufaf2Q59J78 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ndufaf2Q59J78 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
Ndufaf2Q59J78 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ndufaf2Q59J78 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ndufaf2Q59J78 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ndufaf2Q59J78 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
Ndufaf2Q59J78 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ndufaf2Q59J78 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ndufaf2Q59J78 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ndufaf2Q59J78 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ndufaf2Q59J78 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ndufaf2Q59J78 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.6 ms