Protein–RNA interactions for Protein: Q587J6

L1td1, LINE-1 type transposase domain-containing protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 782 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
L1td1Q587J6 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
L1td1Q587J6 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
L1td1Q587J6 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
L1td1Q587J6 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
L1td1Q587J6 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
L1td1Q587J6 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC20.2■□□□□ 0.82
L1td1Q587J6 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
L1td1Q587J6 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
L1td1Q587J6 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
L1td1Q587J6 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
L1td1Q587J6 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
L1td1Q587J6 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
L1td1Q587J6 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
L1td1Q587J6 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
L1td1Q587J6 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
L1td1Q587J6 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
L1td1Q587J6 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
L1td1Q587J6 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
L1td1Q587J6 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
L1td1Q587J6 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
L1td1Q587J6 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
L1td1Q587J6 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
L1td1Q587J6 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
L1td1Q587J6 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
L1td1Q587J6 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
L1td1Q587J6 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
L1td1Q587J6 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
L1td1Q587J6 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
L1td1Q587J6 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
L1td1Q587J6 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
L1td1Q587J6 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
L1td1Q587J6 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
L1td1Q587J6 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
L1td1Q587J6 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
L1td1Q587J6 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
L1td1Q587J6 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
L1td1Q587J6 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
L1td1Q587J6 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
L1td1Q587J6 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
L1td1Q587J6 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
L1td1Q587J6 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
L1td1Q587J6 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
L1td1Q587J6 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
L1td1Q587J6 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
L1td1Q587J6 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
L1td1Q587J6 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
L1td1Q587J6 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
L1td1Q587J6 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
L1td1Q587J6 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
L1td1Q587J6 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
L1td1Q587J6 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
L1td1Q587J6 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
L1td1Q587J6 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
L1td1Q587J6 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
L1td1Q587J6 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
L1td1Q587J6 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
L1td1Q587J6 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
L1td1Q587J6 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
L1td1Q587J6 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
L1td1Q587J6 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
L1td1Q587J6 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
L1td1Q587J6 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
L1td1Q587J6 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
L1td1Q587J6 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
L1td1Q587J6 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
L1td1Q587J6 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
L1td1Q587J6 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
L1td1Q587J6 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
L1td1Q587J6 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
L1td1Q587J6 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
L1td1Q587J6 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
L1td1Q587J6 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
L1td1Q587J6 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
L1td1Q587J6 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
L1td1Q587J6 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
L1td1Q587J6 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
L1td1Q587J6 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
L1td1Q587J6 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
L1td1Q587J6 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
L1td1Q587J6 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
L1td1Q587J6 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
L1td1Q587J6 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
L1td1Q587J6 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
L1td1Q587J6 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
L1td1Q587J6 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
L1td1Q587J6 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
L1td1Q587J6 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
L1td1Q587J6 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
L1td1Q587J6 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
L1td1Q587J6 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
L1td1Q587J6 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
L1td1Q587J6 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
L1td1Q587J6 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
L1td1Q587J6 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
L1td1Q587J6 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
L1td1Q587J6 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
L1td1Q587J6 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
L1td1Q587J6 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
L1td1Q587J6 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
L1td1Q587J6 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.6 ms