Protein–RNA interactions for Protein: Q569L8

Cenpj, Centromere protein J, mousemouse

Predictions only

Length 1,344 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CenpjQ569L8 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CenpjQ569L8 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CenpjQ569L8 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CenpjQ569L8 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
CenpjQ569L8 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CenpjQ569L8 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CenpjQ569L8 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CenpjQ569L8 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
CenpjQ569L8 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CenpjQ569L8 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CenpjQ569L8 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CenpjQ569L8 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CenpjQ569L8 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CenpjQ569L8 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CenpjQ569L8 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CenpjQ569L8 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CenpjQ569L8 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CenpjQ569L8 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CenpjQ569L8 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
CenpjQ569L8 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CenpjQ569L8 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CenpjQ569L8 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CenpjQ569L8 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CenpjQ569L8 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CenpjQ569L8 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
CenpjQ569L8 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CenpjQ569L8 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CenpjQ569L8 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CenpjQ569L8 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
CenpjQ569L8 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CenpjQ569L8 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CenpjQ569L8 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CenpjQ569L8 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CenpjQ569L8 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CenpjQ569L8 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CenpjQ569L8 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CenpjQ569L8 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CenpjQ569L8 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CenpjQ569L8 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CenpjQ569L8 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CenpjQ569L8 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CenpjQ569L8 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
CenpjQ569L8 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CenpjQ569L8 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CenpjQ569L8 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
CenpjQ569L8 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
CenpjQ569L8 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.59
CenpjQ569L8 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
CenpjQ569L8 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
CenpjQ569L8 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CenpjQ569L8 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
CenpjQ569L8 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CenpjQ569L8 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
CenpjQ569L8 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
CenpjQ569L8 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CenpjQ569L8 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CenpjQ569L8 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CenpjQ569L8 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CenpjQ569L8 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CenpjQ569L8 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CenpjQ569L8 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CenpjQ569L8 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
CenpjQ569L8 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CenpjQ569L8 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CenpjQ569L8 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CenpjQ569L8 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CenpjQ569L8 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CenpjQ569L8 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
CenpjQ569L8 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CenpjQ569L8 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CenpjQ569L8 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CenpjQ569L8 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CenpjQ569L8 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CenpjQ569L8 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CenpjQ569L8 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CenpjQ569L8 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CenpjQ569L8 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
CenpjQ569L8 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CenpjQ569L8 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CenpjQ569L8 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CenpjQ569L8 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CenpjQ569L8 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CenpjQ569L8 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CenpjQ569L8 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CenpjQ569L8 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CenpjQ569L8 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CenpjQ569L8 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CenpjQ569L8 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CenpjQ569L8 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CenpjQ569L8 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CenpjQ569L8 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CenpjQ569L8 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CenpjQ569L8 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
CenpjQ569L8 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CenpjQ569L8 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CenpjQ569L8 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CenpjQ569L8 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
CenpjQ569L8 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CenpjQ569L8 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
CenpjQ569L8 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.3 ms