Protein–RNA interactions for Protein: Q499D0

Foxn3, Forkhead box protein N3, mousemouse

Predictions only

Length 457 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Foxn3Q499D0 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Foxn3Q499D0 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Foxn3Q499D0 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Foxn3Q499D0 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Foxn3Q499D0 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Foxn3Q499D0 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Foxn3Q499D0 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Foxn3Q499D0 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Foxn3Q499D0 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Foxn3Q499D0 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Foxn3Q499D0 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Foxn3Q499D0 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Foxn3Q499D0 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Foxn3Q499D0 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Foxn3Q499D0 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Foxn3Q499D0 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Foxn3Q499D0 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Foxn3Q499D0 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Foxn3Q499D0 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Foxn3Q499D0 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Foxn3Q499D0 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Foxn3Q499D0 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Foxn3Q499D0 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Foxn3Q499D0 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Foxn3Q499D0 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Foxn3Q499D0 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Foxn3Q499D0 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Foxn3Q499D0 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Foxn3Q499D0 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC20.14■□□□□ 0.82
Foxn3Q499D0 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Foxn3Q499D0 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Foxn3Q499D0 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Foxn3Q499D0 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Foxn3Q499D0 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Foxn3Q499D0 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Foxn3Q499D0 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Foxn3Q499D0 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Foxn3Q499D0 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Foxn3Q499D0 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Foxn3Q499D0 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Foxn3Q499D0 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Foxn3Q499D0 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Foxn3Q499D0 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Foxn3Q499D0 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Foxn3Q499D0 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Foxn3Q499D0 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Foxn3Q499D0 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Foxn3Q499D0 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Foxn3Q499D0 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Foxn3Q499D0 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Foxn3Q499D0 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Foxn3Q499D0 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Foxn3Q499D0 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Foxn3Q499D0 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Foxn3Q499D0 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Foxn3Q499D0 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Foxn3Q499D0 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Foxn3Q499D0 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Foxn3Q499D0 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Foxn3Q499D0 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Foxn3Q499D0 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Foxn3Q499D0 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Foxn3Q499D0 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Foxn3Q499D0 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Foxn3Q499D0 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Foxn3Q499D0 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Foxn3Q499D0 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Foxn3Q499D0 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Foxn3Q499D0 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Foxn3Q499D0 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Foxn3Q499D0 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Foxn3Q499D0 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Foxn3Q499D0 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Foxn3Q499D0 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Foxn3Q499D0 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Foxn3Q499D0 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Foxn3Q499D0 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Foxn3Q499D0 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Foxn3Q499D0 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Foxn3Q499D0 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Foxn3Q499D0 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Foxn3Q499D0 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Foxn3Q499D0 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Foxn3Q499D0 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Foxn3Q499D0 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Foxn3Q499D0 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Foxn3Q499D0 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Foxn3Q499D0 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Foxn3Q499D0 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Foxn3Q499D0 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Foxn3Q499D0 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Foxn3Q499D0 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Foxn3Q499D0 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Foxn3Q499D0 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Foxn3Q499D0 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Foxn3Q499D0 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Foxn3Q499D0 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Foxn3Q499D0 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Foxn3Q499D0 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Foxn3Q499D0 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.4 ms