Protein–RNA interactions for Protein: Q3V3V9

Carmil2, Capping protein, Arp2/3 and myosin-I linker protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,296 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Carmil2Q3V3V9 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Carmil2Q3V3V9 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Carmil2Q3V3V9 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Carmil2Q3V3V9 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Carmil2Q3V3V9 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Carmil2Q3V3V9 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Carmil2Q3V3V9 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Carmil2Q3V3V9 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Carmil2Q3V3V9 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Carmil2Q3V3V9 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Carmil2Q3V3V9 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Carmil2Q3V3V9 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Carmil2Q3V3V9 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Carmil2Q3V3V9 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Carmil2Q3V3V9 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Carmil2Q3V3V9 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Carmil2Q3V3V9 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Carmil2Q3V3V9 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Carmil2Q3V3V9 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Carmil2Q3V3V9 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Carmil2Q3V3V9 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Carmil2Q3V3V9 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Carmil2Q3V3V9 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Carmil2Q3V3V9 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Carmil2Q3V3V9 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Carmil2Q3V3V9 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Carmil2Q3V3V9 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Carmil2Q3V3V9 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Carmil2Q3V3V9 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Carmil2Q3V3V9 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Carmil2Q3V3V9 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Carmil2Q3V3V9 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Carmil2Q3V3V9 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Carmil2Q3V3V9 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Carmil2Q3V3V9 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Carmil2Q3V3V9 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
Carmil2Q3V3V9 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Carmil2Q3V3V9 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
Carmil2Q3V3V9 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Carmil2Q3V3V9 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Carmil2Q3V3V9 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Carmil2Q3V3V9 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Carmil2Q3V3V9 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Carmil2Q3V3V9 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Carmil2Q3V3V9 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Carmil2Q3V3V9 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Carmil2Q3V3V9 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Carmil2Q3V3V9 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Carmil2Q3V3V9 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Carmil2Q3V3V9 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Carmil2Q3V3V9 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Carmil2Q3V3V9 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Carmil2Q3V3V9 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Carmil2Q3V3V9 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Carmil2Q3V3V9 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
Carmil2Q3V3V9 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Carmil2Q3V3V9 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Carmil2Q3V3V9 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Carmil2Q3V3V9 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Carmil2Q3V3V9 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Carmil2Q3V3V9 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Carmil2Q3V3V9 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Carmil2Q3V3V9 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Carmil2Q3V3V9 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Carmil2Q3V3V9 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Carmil2Q3V3V9 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Carmil2Q3V3V9 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Carmil2Q3V3V9 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Carmil2Q3V3V9 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Carmil2Q3V3V9 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Carmil2Q3V3V9 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Carmil2Q3V3V9 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Carmil2Q3V3V9 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Carmil2Q3V3V9 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Carmil2Q3V3V9 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Carmil2Q3V3V9 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Carmil2Q3V3V9 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Carmil2Q3V3V9 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Carmil2Q3V3V9 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Carmil2Q3V3V9 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Carmil2Q3V3V9 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Carmil2Q3V3V9 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
Carmil2Q3V3V9 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Carmil2Q3V3V9 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Carmil2Q3V3V9 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Carmil2Q3V3V9 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Carmil2Q3V3V9 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Carmil2Q3V3V9 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Carmil2Q3V3V9 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Carmil2Q3V3V9 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Carmil2Q3V3V9 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Carmil2Q3V3V9 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Carmil2Q3V3V9 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Carmil2Q3V3V9 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Carmil2Q3V3V9 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Carmil2Q3V3V9 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Carmil2Q3V3V9 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Carmil2Q3V3V9 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Carmil2Q3V3V9 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Carmil2Q3V3V9 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.8 ms